Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 MGAT4C-202ENST00000548651 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 SCN2A-215ENST00000637266 8610 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC2.15□□□□□ -2.06
SMG1Q96Q15 MIR137-201ENST00000385223 102 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 C8orf22-202ENST00000399653 1272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 P4HA2-AS1-201ENST00000417667 839 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 WDR61-205ENST00000558459 884 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 GMFB-210ENST00000628554 639 ntTSL 4 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC020900.1-201ENST00000502568 565 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC104232.2-201ENST00000519680 769 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 GCSAML-207ENST00000527541 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC010338.1-201ENST00000621823 717 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 BCLAF1-214ENST00000531224 7263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 TFPI-204ENST00000409676 1119 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RNU2-17P-201ENST00000410290 190 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPS15AP12-201ENST00000419498 388 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 KCTD9P5-201ENST00000504141 1170 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 CR589904.2-201ENST00000612533 440 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC107871.2-201ENST00000612894 502 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC008121.2-201ENST00000614647 523 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 SEL1L2-202ENST00000378072 1892 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL591416.1-201ENST00000404015 867 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AP000275.1-201ENST00000411943 390 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL365396.1-201ENST00000430854 671 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC011037.1-201ENST00000483964 558 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC007876.1-201ENST00000527562 983 ntTSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL353651.2-201ENST00000635706 559 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 MTND4P10-201ENST00000446199 1363 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 SPATA17-201ENST00000366933 5818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC105918.1-201ENST00000474399 838 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 DYNLL1P6-201ENST00000503440 264 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC104211.1-202ENST00000521307 866 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RMST_9.1-201ENST00000619945 193 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC007342.7-201ENST00000624610 2337 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 DNAH8-202ENST00000359357 13864 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 NR1H5P-201ENST00000452683 1377 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ATP7A-201ENST00000341514 8483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 KLRC2-201ENST00000381901 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 SLC14A2-AS1-204ENST00000592899 359 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL583832.1-201ENST00000603227 784 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 OR5K3-201ENST00000383695 966 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC011773.3-201ENST00000546501 589 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AL355836.1-201ENST00000555951 870 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 LINC01862-201ENST00000593792 478 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC126118.1-201ENST00000607744 628 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
SMG1Q96Q15 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
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