Protein–RNA interactions for Protein: Q96IU2

ZBED3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 234 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED3Q96IU2 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 FRS2-201ENST00000397997 6550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU2-21P-201ENST00000410368 188 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 TTTY20-201ENST00000434487 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC008080.4-202ENST00000440034 1005 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 HMGB1P38-201ENST00000490557 577 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SCOC-206ENST00000506322 687 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RN7SKP283-201ENST00000517197 270 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AP001205.1-201ENST00000521625 449 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC022511.1-201ENST00000544089 476 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC010198.2-201ENST00000550612 259 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC084033.1-201ENST00000550830 633 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC130650.1-201ENST00000570581 415 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC107982.2-201ENST00000577360 463 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 LINC01899-201ENST00000580323 312 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC091691.2-201ENST00000581940 567 ntTSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC011524.2-201ENST00000589198 399 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SYNE1-201ENST00000341594 26584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AP001350.1-201ENST00000601906 1524 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 DPP10-205ENST00000410059 6278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 CEP85L-202ENST00000368488 7118 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 EIF1AY-202ENST00000382772 746 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MIR7-1-201ENST00000384871 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MIR34A-201ENST00000385130 110 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL353771.1-201ENST00000422107 457 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC099520.1-203ENST00000506976 464 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC017037.2-201ENST00000513850 890 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AP002812.3-201ENST00000527012 551 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AP000722.1-201ENST00000531176 775 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC025260.1-201ENST00000548858 430 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 C15orf65-201ENST00000569691 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC008507.1-201ENST00000587506 734 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC097717.1-250ENST00000608498 273 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC119674.1-220ENST00000641502 1048 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SULT1B1-201ENST00000310613 7115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 CRISP3-201ENST00000263045 2170 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC005183.1-201ENST00000603687 1979 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 ZNF322-205ENST00000471278 2675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 U3.42-201ENST00000408746 214 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RPL7P29-201ENST00000437151 728 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 TXNP1-201ENST00000441872 371 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RPL7P36-201ENST00000444633 681 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RPL7P52-201ENST00000449200 742 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SCOC-205ENST00000502535 679 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 TMEM248P1-201ENST00000510579 951 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RFESD-208ENST00000513950 464 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AP001636.3-202ENST00000525714 894 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC091814.1-201ENST00000545258 719 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SERPINE4P-201ENST00000554978 281 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AC080078.1-201ENST00000603643 410 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 AL356490.1-201ENST00000623079 479 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 SLC8A1-207ENST00000406785 20987 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.86
ZBED3Q96IU2 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL356057.1-202ENST00000402263 756 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 AC005517.2-201ENST00000424673 553 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 FAR1P1-201ENST00000427163 934 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 RPS20P5-201ENST00000434808 360 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED3Q96IU2 ELOCP13-201ENST00000443934 329 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
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