Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00977-201ENST00000509893 1163 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC117834.1-202ENST00000521203 561 ntTSL 4 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP001804.3-201ENST00000525146 880 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 THEM7P-202ENST00000525689 764 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OR4A12P-201ENST00000530847 918 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL035078.2-201ENST00000533832 326 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC073655.2-202ENST00000547927 401 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP27-201ENST00000555160 670 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC090666.1-201ENST00000578241 445 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP001542.2-201ENST00000593141 364 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 KLHL23-207ENST00000602521 630 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC106028.5-201ENST00000610332 395 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 NCAPGP1-201ENST00000505112 1814 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ATM-203ENST00000452508 12954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL365440.2-201ENST00000419738 2597 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SPANXN4-201ENST00000370504 560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02089-201ENST00000412360 682 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 TRIAP1P1-201ENST00000427062 225 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC140076.1-201ENST00000449897 361 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPS3AP6-201ENST00000484430 795 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02325-201ENST00000499910 1115 ntTSL 1 (best) BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC093879.2-201ENST00000513645 427 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC068339.2-201ENST00000534395 618 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL359233.1-201ENST00000554029 364 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL133457.1-201ENST00000564251 987 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01515-204ENST00000595269 402 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL031985.2-201ENST00000600955 480 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP003973.1-201ENST00000604639 691 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC073387.2-201ENST00000604797 784 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OR5H6-202ENST00000641416 1032 ntAPPRIS P1 BASIC3.85□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 PCLO-206ENST00000437081 3786 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD51-201ENST00000384320 80 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL355615.1-201ENST00000406187 641 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 PSMA4-202ENST00000413382 1019 ntTSL 1 (best) BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL354766.2-201ENST00000414085 423 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC245052.5-201ENST00000416320 649 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL845311.1-201ENST00000444791 891 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL096829.2-201ENST00000446582 742 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 KLRA1P-201ENST00000503499 986 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC108062.1-201ENST00000505133 637 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 BOLA3P3-201ENST00000505182 232 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC004069.2-201ENST00000505438 1114 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC093903.1-201ENST00000507220 405 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC091906.1-201ENST00000511310 391 ntTSL 2 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P27-201ENST00000514397 196 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1095P-201ENST00000516148 108 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP003355.1-201ENST00000518956 587 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC093331.1-201ENST00000521474 169 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL133279.1-201ENST00000553487 473 ntTSL 3 BASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC027807.1-201ENST00000559921 996 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2IP8-201ENST00000560687 584 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC3.84□□□□□ -1.79
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