Protein–RNA interactions for Protein: Q8N1Q1

CA13, Carbonic anhydrase 13, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CA13Q8N1Q1 AC108750.1-201ENST00000637986 2706 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.89□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 JMJD1C-210ENST00000542921 8149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.89□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 U3.6-201ENST00000363622 211 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RNU6-805P-201ENST00000365643 106 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 DEFB127-201ENST00000382388 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RNU6-761P-201ENST00000384148 107 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SNORA9-201ENST00000384215 133 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 MIR491-201ENST00000384877 84 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SNORA11.1-201ENST00000408133 129 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RNA5SP56-201ENST00000410277 118 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RPS15AP6-201ENST00000420703 385 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RPL23AP22-201ENST00000437556 453 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 ZCCHC10-207ENST00000509437 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC067817.1-201ENST00000518535 356 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC105180.1-201ENST00000523317 426 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 PSMA2P1-201ENST00000526365 646 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AL161804.1-201ENST00000555600 708 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC023510.1-201ENST00000555862 490 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC037471.2-201ENST00000564941 598 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC012254.4-201ENST00000588843 273 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC011139.1-202ENST00000637744 563 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 ROS1-202ENST00000368508 7435 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 NUP35-203ENST00000409798 1470 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 TMEM68-218ENST00000617782 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 NT5C3A-203ENST00000396152 1788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC020571.1-202ENST00000433933 1413 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC073055.1-201ENST00000456901 1621 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RNU6-444P-201ENST00000383988 108 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RN7SKP220-201ENST00000410611 288 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AL024507.1-201ENST00000412741 274 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 UBE2V1P9-201ENST00000414760 368 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC023128.1-201ENST00000432431 799 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 HIGD1AP11-201ENST00000438361 280 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC064874.1-202ENST00000440101 287 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC018359.1-201ENST00000442567 574 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 BX248409.1-201ENST00000455497 255 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC097467.3-212ENST00000512269 568 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 LINC02384-206ENST00000541707 904 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 CACNA1C-AS4-201ENST00000544415 735 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SRP54-AS1-203ENST00000556355 603 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC024270.4-201ENST00000570202 421 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC145207.6-201ENST00000579981 782 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AL109653.1-201ENST00000603091 248 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SMIM18-202ENST00000626298 114 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SATB1-AS1-258ENST00000629405 664 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC245427.9-201ENST00000633713 53 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 EYS-204ENST00000370621 10485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC011124.1-201ENST00000521221 1762 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC004972.1-201ENST00000623934 2209 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 CC2D2B-210ENST00000636965 3247 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 AC118273.1-201ENST00000525324 3006 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 NRG4-201ENST00000394907 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 ERMN-204ENST00000409925 556 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CA13Q8N1Q1 RNA5SP293-201ENST00000410527 113 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.9 ms