Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 AL133173.1-201ENST00000423458 397 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MRPS21P2-201ENST00000424704 264 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC073069.1-201ENST00000428657 441 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL713851.2-201ENST00000431209 332 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL451139.1-201ENST00000434718 346 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL390119.1-201ENST00000440329 312 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL035090.1-201ENST00000454835 332 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC022445.1-201ENST00000457499 408 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 UBA52P7-201ENST00000486088 380 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC055855.1-201ENST00000489563 579 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RPS4XP14-201ENST00000493072 781 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RN7SL466P-201ENST00000497546 295 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC112198.3-201ENST00000505950 441 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 ATP5LP3-201ENST00000514223 304 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 IGKV2-36-201ENST00000519999 223 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC073525.1-202ENST00000550049 732 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC113208.4-201ENST00000563568 206 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MIR7853-201ENST00000584820 132 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC004542.1-201ENST00000602955 264 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 NOX4-205ENST00000424319 4184 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 ZNF658-201ENST00000612867 4160 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 ZNF891-201ENST00000537226 15455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 DSPP-201ENST00000282478 4281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 FIGN-201ENST00000333129 9536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 DLG1-210ENST00000422288 2854 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 IGSF11-AS1-201ENST00000477009 1604 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 ZNF788-203ENST00000430298 3941 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC5□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 C2orf73-202ENST00000398634 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 UBR5-204ENST00000518205 1931 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 NAMPTP1-201ENST00000440465 2514 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 DHX40P1-201ENST00000588725 1412 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 ADAM29-202ENST00000404450 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RAB3GAP1-207ENST00000539493 3161 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MAP3K7-203ENST00000369327 4558 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 KIAA0408-204ENST00000483725 3284 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MKKS-202ENST00000399054 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 LMOD2-202ENST00000458573 2346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RNU6-770P-201ENST00000363929 105 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL356421.1-201ENST00000403255 413 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MIR548I2-201ENST00000408348 149 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RN7SKP293-201ENST00000411389 296 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 OR2AT2P-201ENST00000413438 905 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC068533.1-201ENST00000418542 415 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 BX510359.3-201ENST00000422168 306 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 PDSS1P1-201ENST00000422953 1114 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL354766.1-201ENST00000423396 542 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL031663.1-201ENST00000437445 219 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC019185.1-201ENST00000442718 389 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 ABCC13-202ENST00000463099 3842 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RN7SL214P-201ENST00000487317 265 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC136777.1-201ENST00000517765 369 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC087318.1-201ENST00000536786 389 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 SNORD39.2-201ENST00000579995 76 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC012616.1-201ENST00000600294 197 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 HOTTIP_3.1-201ENST00000619957 337 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 uc_338.7-201ENST00000621834 124 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 MPP6-209ENST00000625307 126 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC079601.1-201ENST00000547824 2791 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 DGKB-201ENST00000399322 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AP001605.1-201ENST00000420186 2603 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 FLG2-201ENST00000388718 9124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 STEAP2-205ENST00000394629 2261 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 SPAM1-201ENST00000223028 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 RFX4-201ENST00000229387 3378 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
ATG4DQ86TL0 AC087473.1-201ENST00000561320 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.8 ms