Protein–RNA interactions for Protein: Q1L6U9

MSMP, Prostate-associated microseminoprotein, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMPQ1L6U9 RNA5SP30-201ENST00000365552 115 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNA5SP91-201ENST00000390902 119 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SAR1AP2-201ENST00000392696 594 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RN7SKP206-201ENST00000410823 293 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 BMS1P17-202ENST00000416720 316 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL390243.1-201ENST00000422038 708 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 TSSK4-203ENST00000428351 576 ntTSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL021408.1-201ENST00000430428 552 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC092162.1-201ENST00000432828 434 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL353597.2-202ENST00000434901 373 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RHOT1P3-201ENST00000436571 331 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RN7SL717P-201ENST00000478343 297 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RPL23AP55-201ENST00000498163 452 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RN7SL284P-201ENST00000498823 275 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC122710.1-201ENST00000510622 553 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC034238.3-201ENST00000512349 591 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-397P-201ENST00000516226 104 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL133153.1-201ENST00000557756 303 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MIR4260-201ENST00000583107 67 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC015908.2-202ENST00000585243 756 ntTSL 3 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC006115.2-201ENST00000596823 202 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL352984.2-202ENST00000613699 155 ntBASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PROX1-AS1-244ENST00000630355 599 ntTSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 TMPRSS15-201ENST00000284885 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RPL23AP82-206ENST00000480246 2987 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AAK1-203ENST00000409085 11345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 OR2H1-201ENST00000377132 2253 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 OR52N5-202ENST00000641181 2778 ntAPPRIS P1 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PTPRO-203ENST00000442921 3030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ANKRD49-208ENST00000544253 3002 ntTSL 1 (best) BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PUS10-203ENST00000407787 1820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.9□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC010329.1-201ENST00000593903 8328 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 KATNA1-202ENST00000335647 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PLCE1-201ENST00000371375 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 EPC2-201ENST00000258484 3649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC090510.1-202ENST00000500850 2017 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 USP46-201ENST00000441222 7954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 HECW2-201ENST00000260983 11809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 FAM197Y8-201ENST00000426661 2340 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 FAM197Y6-202ENST00000442145 2340 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LRRC7-203ENST00000370958 2375 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF24-201ENST00000261332 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 GNG5P2-201ENST00000372054 207 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 PCNPP3-201ENST00000393579 471 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC011754.1-201ENST00000415201 491 ntTSL 5 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC008164.1-201ENST00000423925 564 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 MYL8P-204ENST00000431574 518 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC073410.1-201ENST00000435125 589 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 CYCSP34-201ENST00000458172 304 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SNORD97-201ENST00000459187 142 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RN7SL570P-201ENST00000484405 292 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RBBP4P6-201ENST00000508098 202 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LINC02432-203ENST00000511213 719 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-1092P-201ENST00000516955 87 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 RNU6-685P-201ENST00000517088 95 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LINC02186-201ENST00000575767 885 ntTSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LINC02563-201ENST00000579474 277 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC011445.2-201ENST00000599274 173 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL352984.2-201ENST00000611153 546 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 HNF1A-AS1-205ENST00000619441 343 ntTSL 3 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL355480.1-201ENST00000629041 99 ntBASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AL359313.1-202ENST00000635073 544 ntTSL 4 BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DTNA-206ENST00000399121 6490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF227-201ENST00000313040 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 THEMIS-206ENST00000630369 2786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.89□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LINC02019-201ENST00000608605 2060 ntBASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 IFIT2-201ENST00000371826 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 EYA4-211ENST00000525849 3456 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 CPED1-203ENST00000423795 2189 ntTSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 DMTF1-204ENST00000413276 3548 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 LAMTOR3-202ENST00000499666 4226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 SPAG9-209ENST00000510283 4949 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
MSMPQ1L6U9 AC092958.1-201ENST00000467198 2569 ntTSL 2 BASIC4.88□□□□□ -1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.6 ms