Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB0

RTL8B, Retrotransposon Gag-like protein 8B, humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL8BQ17RB0 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SNORA11C-201ENST00000408532 129 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL160175.1-201ENST00000428124 247 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC02529-201ENST00000429657 772 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPL21P2-201ENST00000440049 481 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC044797.1-201ENST00000445744 679 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 HMGB1P5-202ENST00000451497 985 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MEPE-206ENST00000511670 550 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SNORA26.10-201ENST00000516427 141 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CIR1P1-201ENST00000524055 1133 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL138812.1-201ENST00000525573 471 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CASC16-202ENST00000563844 610 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC012182.1-201ENST00000570133 895 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC02185-202ENST00000576797 568 ntTSL 3 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC010320.2-202ENST00000599125 595 ntTSL 4 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RBM12B-AS1-201ENST00000623283 653 ntBASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MARCH6-215ENST00000640713 231 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 DDX6-206ENST00000534980 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 LINC02030-201ENST00000492683 1602 ntTSL 5 BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.31□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 RPS3AP25-201ENST00000411660 793 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 AJ239321.1-201ENST00000424255 564 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC009299.3-203ENST00000435692 1096 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 RPL34P26-201ENST00000445636 354 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 NUTM2A-AS1-209ENST00000447424 571 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 TEX41-209ENST00000451478 452 ntTSL 2 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RERG-IT1-201ENST00000539734 301 ntTSL 3 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC007619.1-201ENST00000544086 412 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC023158.1-201ENST00000561632 1025 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
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RTL8BQ17RB0 DUXAP4-201ENST00000603046 613 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 YPEL5P2-201ENST00000605553 359 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC135803.1-201ENST00000608748 565 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AC233263.6-201ENST00000631132 1963 ntBASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC2.3□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 IL1RAPL2-201ENST00000344799 1290 ntTSL 5 BASIC2.29□□□□□ -2.04
RTL8BQ17RB0 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.29□□□□□ -2.04
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