Protein–RNA interactions for Protein: Q17R60

IMPG1, Interphotoreceptor matrix proteoglycan 1, humanhuman

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMPG1Q17R60 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.81□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 EQTN-202ENST00000380032 1033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SNORA54-201ENST00000384281 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MT-TC-201ENST00000387405 66 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 GSTA8P-201ENST00000404253 637 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RNU6-564P-201ENST00000410983 104 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 HSFY1P1-201ENST00000423928 1178 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC006148.2-201ENST00000467017 650 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 VPS26A-206ENST00000489794 928 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MTCYBP37-201ENST00000510642 1133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC133963.2-201ENST00000513686 578 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SNORA31.1-201ENST00000515993 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SNORA31.5-201ENST00000516190 133 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 LY96-202ENST00000518893 430 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 OOSP2-203ENST00000532905 496 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MTCYBP28-201ENST00000566728 1132 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC006504.3-201ENST00000586818 523 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC078899.3-201ENST00000599065 212 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC084036.1-201ENST00000609190 508 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 ZNF280C-201ENST00000370978 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.8□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 CPD-202ENST00000543464 4007 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 ADAM18-206ENST00000520772 1429 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 OSTN-202ENST00000445281 3134 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 CUBN-201ENST00000377823 705 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RPL7P8-201ENST00000411964 730 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MTCO3P12-201ENST00000416718 547 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL449983.1-201ENST00000430640 414 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 snoU13.3-201ENST00000459441 104 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 BLNK-209ENST00000495266 440 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC096576.3-201ENST00000505528 721 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC005699.1-201ENST00000510095 555 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC008871.1-201ENST00000510935 398 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC105914.1-201ENST00000511798 226 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 PANCR-202ENST00000513690 448 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 TMEM68-214ENST00000523073 536 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SMILR-201ENST00000533992 553 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC036103.1-201ENST00000563846 823 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 TFG-209ENST00000615993 1244 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL354696.2-202ENST00000620300 613 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AP003122.6-201ENST00000623831 495 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 ZNF807-201ENST00000328088 1707 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 NT5C3A-202ENST00000381626 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SNORA14A-201ENST00000364773 135 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RNU6-1027P-201ENST00000383998 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC010385.1-201ENST00000412374 256 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL138789.1-201ENST00000425820 960 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC007403.1-201ENST00000427579 567 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SAR1AP4-201ENST00000429225 591 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RPS29P6-201ENST00000438196 145 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL360013.2-201ENST00000440104 807 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC007953.1-201ENST00000450500 560 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL590639.1-201ENST00000456484 337 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC092691.3-201ENST00000482766 510 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 LINC01192-207ENST00000492553 836 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AL358832.1-201ENST00000497800 389 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
IMPG1Q17R60 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 169 ms