Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 AC073172.1-201ENST00000636967 851 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 ANK3-216ENST00000503366 5792 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 BCLAF1-201ENST00000353331 7110 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 GTDC1-220ENST00000618778 2317 ntTSL 5 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 PMP2-201ENST00000256103 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 BX088651.2-201ENST00000425493 3614 ntTSL 2 BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 IBTK-206ENST00000503631 3560 ntTSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 CYP3A7-201ENST00000336374 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.86□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 KLHL28-202ENST00000396128 6545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 ZNF493-203ENST00000392288 5023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 C11orf65-208ENST00000615746 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 SLC16A9-201ENST00000395347 3646 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 FAM91A3P-201ENST00000456826 2544 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 FCRL5-202ENST00000368189 4424 ntTSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 FAT4-202ENST00000394329 16123 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 COL14A1-209ENST00000537875 3119 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 LGALS13-201ENST00000221797 602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.85□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AL117381.1-201ENST00000412972 374 ntTSL 3 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC5.85□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AC107396.1-201ENST00000509641 735 ntTSL 5 BASIC5.85□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 TNFSF18-201ENST00000404377 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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ECM1Q16610 AC005702.2-201ENST00000591035 481 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AP005432.2-201ENST00000608162 586 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 MIR6826-201ENST00000617808 98 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 AC023421.1-201ENST00000590535 1785 ntBASIC5.84□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 IFRD1-217ENST00000621379 3232 ntTSL 2 BASIC5.84□□□□□ -1.47
ECM1Q16610 B3GNT5-201ENST00000326505 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.84□□□□□ -1.47
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