Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OR5M10-201ENST00000526812 1052 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP002989.1-201ENST00000533459 562 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ACTR3BP3-201ENST00000565577 979 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC010546.1-201ENST00000569391 485 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR5708-201ENST00000579723 85 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01905-206ENST00000593180 524 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZNF726-205ENST00000575986 1522 ntTSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MFN1-201ENST00000263969 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTND5P29-201ENST00000458676 1807 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 C5orf42-205ENST00000508244 11062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC01828-203ENST00000452716 3250 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ARPP19-211ENST00000568196 1489 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNF38-203ENST00000353739 4945 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL391994.1-201ENST00000254724 282 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LY96-201ENST00000284818 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RNU6-707P-201ENST00000364647 95 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 U8.11-201ENST00000384699 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 U8.12-201ENST00000384701 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR142-201ENST00000384835 87 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NPM1P11-201ENST00000417106 855 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 OFD1P11Y-201ENST00000418213 1177 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL138785.1-201ENST00000425821 331 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC064852.1-201ENST00000427571 851 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 FO393419.3-201ENST00000428741 282 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 USP9YP31-201ENST00000431405 881 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPS24P1-201ENST00000438550 371 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPS26P30-201ENST00000443431 335 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 RPL12P26-201ENST00000452430 487 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 UBDP1-202ENST00000457888 382 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 U8.18-201ENST00000459285 133 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC004801.2-202ENST00000463559 283 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC004884.2-201ENST00000476569 546 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC108120.2-201ENST00000512973 294 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC008837.2-201ENST00000513076 418 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC103957.1-202ENST00000519814 735 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC120042.2-201ENST00000521556 667 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 FBXO3-AS1-202ENST00000533046 386 ntTSL 3 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 HIGD1AP17-201ENST00000554576 276 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL049870.4-201ENST00000555741 486 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 IGKV2OR2-8-201ENST00000558710 300 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 MIR4999-201ENST00000585029 91 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 NTAN1P1-201ENST00000603150 646 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL592295.2-201ENST00000612578 206 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 THOC1-220ENST00000621904 1083 ntTSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC119674.1-212ENST00000641155 993 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AL021368.2-201ENST00000606125 5352 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 AP005901.5-201ENST00000545779 1796 ntBASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 TMEM71-202ENST00000377901 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 FOXP2-224ENST00000635534 4290 ntTSL 5 BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 SLC16A7-201ENST00000261187 11777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.35□□□□□ -1.87
ZNF239Q16600 LINC02393-202ENST00000614177 1993 ntTSL 2 BASIC3.35□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.1 ms