Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL583810.3-201ENST00000555713 584 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ZNF682-204ENST00000593468 581 ntTSL 4 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC012065.4-201ENST00000602445 679 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 WASF3-AS1-206ENST00000626779 381 ntTSL 5 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 C6-201ENST00000263413 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 USP29-202ENST00000598197 3284 ntAPPRIS P1 BASIC5.35□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 Z95327.2-201ENST00000414579 1873 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 ARHGEF12-202ENST00000397843 9660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 UBTFL3-201ENST00000418934 1024 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 F10-AS1-201ENST00000424635 417 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL513422.1-201ENST00000449531 383 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 MEMO1P3-201ENST00000459811 302 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 UBTFL6-201ENST00000477929 1024 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 BNIP3P41-201ENST00000503774 571 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC114981.1-201ENST00000503897 678 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 EIF4E-208ENST00000505992 898 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC109927.2-201ENST00000506416 303 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC074250.1-201ENST00000511117 192 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC098868.1-201ENST00000512628 624 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AP001961.1-201ENST00000515782 526 ntTSL 3 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC011363.1-201ENST00000524198 458 ntTSL 5 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AL133166.1-201ENST00000551040 1034 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC018552.3-201ENST00000567416 561 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 AC117529.2-201ENST00000512159 2068 ntBASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.55
DDB1Q16531 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC5.34□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ZNF285-205ENST00000614994 6012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.34□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 USP44-201ENST00000258499 4022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ADAM7-201ENST00000175238 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 PMCHL1-201ENST00000418902 1917 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TUG1-201ENST00000519077 5673 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNA5SP391-201ENST00000363456 119 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 BPIFC-202ENST00000397450 458 ntTSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MRPL30-202ENST00000409145 562 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 HMGB1P11-201ENST00000413899 637 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 SLC44A3-AS1-205ENST00000424505 612 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RPS26P56-201ENST00000444468 240 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC239809.1-201ENST00000450470 217 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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DDB1Q16531 AC113430.1-201ENST00000506872 718 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
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DDB1Q16531 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC129510.2-201ENST00000582774 345 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC022601.1-201ENST00000596954 577 ntTSL 4 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AL442067.2-201ENST00000614033 363 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC018755.4-201ENST00000619715 454 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 U6.105-201ENST00000637379 88 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ZNF345-216ENST00000640438 963 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ELF2-203ENST00000379550 3278 ntTSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC083843.3-201ENST00000623679 2186 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 CAB39L-206ENST00000410043 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 MAPK10-372ENST00000641954 3413 ntBASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ZNF682-209ENST00000597972 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.33□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 NFIB-211ENST00000606230 2311 ntTSL 5 BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 ZNF382-204ENST00000439428 2742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
DDB1Q16531 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC5.32□□□□□ -1.56
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