Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL365356.5-201ENST00000478294 697 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC008652.1-201ENST00000505261 469 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC02064-202ENST00000507876 403 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC093824.1-201ENST00000508796 343 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC026991.1-201ENST00000520815 463 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OR5AP1P-201ENST00000529730 940 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC02468-201ENST00000543778 633 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC026116.1-201ENST00000551729 474 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL355773.1-201ENST00000554458 459 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AP005120.1-201ENST00000579321 352 ntTSL 3 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC083760.1-201ENST00000589621 670 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL355812.1-201ENST00000603215 216 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC068276.1-201ENST00000605793 379 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL451064.1-201ENST00000607718 471 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 DAOA-AS1_2.2-201ENST00000610818 204 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL445264.1-201ENST00000621719 171 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC090582.1-201ENST00000636321 199 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ZNF705A-201ENST00000359286 3455 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LRRC49-222ENST00000560158 1898 ntTSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RIMS1-206ENST00000425662 2799 ntTSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.04□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MS4A14-203ENST00000395005 2813 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LRRC39-204ENST00000620882 1951 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 C8orf34-203ENST00000348340 3571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ZNF480-202ENST00000335090 2722 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OR11H5P-202ENST00000641612 1325 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC087190.4-201ENST00000574616 8334 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 STXBP4-204ENST00000434978 2807 ntTSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MTND4LP20-201ENST00000402379 270 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MIR1305-201ENST00000408300 86 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL133480.1-201ENST00000411561 638 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPL17P12-201ENST00000413391 526 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OFD1P18Y-201ENST00000420889 959 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 PSMA6P3-201ENST00000428242 164 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MUPP-201ENST00000438111 566 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC133473.1-201ENST00000455173 299 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RPL21P103-201ENST00000479921 488 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC068633.1-201ENST00000482142 787 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OR5H5P-201ENST00000503164 928 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC022447.3-201ENST00000506865 495 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 IGKV2D-36-201ENST00000518643 226 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC136424.2-201ENST00000522582 563 ntTSL 4 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC090857.2-201ENST00000526362 723 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC024224.1-201ENST00000538284 609 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC073591.1-201ENST00000552736 597 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AL162872.1-201ENST00000557709 448 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MTND6P33-201ENST00000571794 183 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC129492.2-201ENST00000577807 517 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MIR3160-1-201ENST00000577972 85 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LINC00649-204ENST00000593977 640 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 LLPHP1-201ENST00000603571 367 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC067959.1-201ENST00000604334 379 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 AC138393.3-201ENST00000618397 573 ntTSL 3 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ZRANB2-AS2-222ENST00000625045 1014 ntTSL 5 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 OR11H4-203ENST00000641525 1082 ntAPPRIS P1 BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 MNDA-201ENST00000368141 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
RPE65Q16518 ORC3-201ENST00000257789 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.03□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 101.2 ms