Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC084116.2-201ENST00000520171 415 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC015468.4-201ENST00000523496 568 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MFAP5-212ENST00000543369 972 ntTSL 3 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC007686.2-201ENST00000554043 469 ntTSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC105094.2-203ENST00000590357 555 ntTSL 4 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC005255.1-201ENST00000593748 216 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC007546.1-201ENST00000619452 559 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 OR10A6-202ENST00000623991 945 ntAPPRIS P1 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 U6.101-201ENST00000637707 76 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RAPGEF6-201ENST00000296859 5618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL139811.1-201ENST00000424779 2299 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL356473.1-201ENST00000406203 1408 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AP002907.1-201ENST00000606361 1430 ntBASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MBD5-202ENST00000407073 9512 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 NPFFR2-203ENST00000358749 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 EVI2B-202ENST00000577894 1597 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CCSER1-201ENST00000432775 3927 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 NR5A2-201ENST00000236914 3115 ntTSL 1 (best) BASIC4.35□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AGBL2-201ENST00000357610 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 IFT80-220ENST00000483465 4044 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ABCC9-201ENST00000261200 8293 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 YWHAZ-201ENST00000353245 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ENPP3-202ENST00000358229 3026 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CXCL10-201ENST00000306602 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNA5SP175-201ENST00000364275 119 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPL31-205ENST00000409320 716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RPS3AP9-201ENST00000417027 792 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL158209.1-201ENST00000433460 439 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 USP9YP7-201ENST00000436723 430 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC010975.1-201ENST00000443301 669 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 VPS29-202ENST00000447578 996 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TPT1P12-201ENST00000448968 492 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 USP9YP32-201ENST00000452432 430 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNU7-136P-201ENST00000458819 69 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC107021.1-202ENST00000480247 555 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 AC016687.2-201ENST00000504795 541 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC139783.2-201ENST00000504847 1145 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC117460.1-201ENST00000508964 467 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 PARP4P3-201ENST00000510265 317 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 OSBPL9P2-201ENST00000526582 1228 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 SPTY2D1-AS1-203ENST00000542172 331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
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CNGA3Q16281 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TIMM9-208ENST00000556007 746 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC087463.4-202ENST00000566676 579 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 MIR3138-201ENST00000585238 82 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AP000403.1-201ENST00000603349 851 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 TIMM9-202ENST00000395159 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 AL158163.1-201ENST00000603915 1649 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
CNGA3Q16281 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SMCO3-201ENST00000316048 2104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SAGE1-203ENST00000537770 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 RNU1-132P-201ENST00000364300 164 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 EQTN-201ENST00000380031 725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 OR6C69P-201ENST00000394268 893 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
CNGA3Q16281 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
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