Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 BX664730.1-201ENST00000616196 800 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC091965.5-201ENST00000624785 342 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC02532-209ENST00000602934 2464 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CKAP5-201ENST00000312055 6532 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL451142.2-201ENST00000429076 2090 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MCF2-201ENST00000338585 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 WDR17-204ENST00000507824 4119 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC134882.1-201ENST00000603738 1676 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CREM-206ENST00000354759 1589 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 C1orf100-202ENST00000366537 483 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 EEF1E1-BLOC1S5-201ENST00000397456 768 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC119751.3-201ENST00000399720 670 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-603P-201ENST00000411403 107 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPL30P2-201ENST00000414021 291 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC007179.1-201ENST00000415159 438 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC100848.1-201ENST00000417298 637 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 Z97055.1-201ENST00000419730 712 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC018742.1-201ENST00000435237 488 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNF148-202ENST00000447240 839 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SCEL-AS1-201ENST00000456280 493 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-1218P-201ENST00000458990 108 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC006511.1-201ENST00000470614 315 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC108734.3-201ENST00000481241 1165 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC005912.1-201ENST00000495392 255 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CTD-2350J17.1-201ENST00000509228 362 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 OCIAD1-AS1-201ENST00000513576 265 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC023202.1-201ENST00000521681 491 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ZFAND1-217ENST00000521895 885 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 IGJP1-201ENST00000522682 475 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC092747.2-201ENST00000545069 983 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AGGF1P8-201ENST00000562979 1000 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC01584-202ENST00000563990 852 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC103808.1-201ENST00000579833 922 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AP001269.3-201ENST00000588718 329 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 AC024563.1-202ENST00000597533 419 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 AP000254.1-201ENST00000609934 520 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC116447.1-201ENST00000613153 453 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 SATB1-AS1-226ENST00000625515 776 ntTSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL928596.1-201ENST00000636738 632 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ABBA01000935.2-201ENST00000637477 838 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 KCNRG-201ENST00000312942 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
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CCDC6Q16204 SGO1P1-201ENST00000603525 1447 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC000367.1-201ENST00000452711 1766 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTND4P31-201ENST00000425607 1343 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AP000526.1-201ENST00000603308 1388 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 C12orf4-201ENST00000261250 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 FAM133CP-201ENST00000332869 704 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 NACA3P-201ENST00000359690 648 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RNU6-304P-201ENST00000364855 107 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC096664.2-201ENST00000411843 406 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPS7P9-201ENST00000414704 586 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AF178030.1-201ENST00000415088 402 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC005062.1-204ENST00000415499 743 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC002454.1-204ENST00000419668 527 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AL139247.1-201ENST00000422768 325 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 GTF2IP23-201ENST00000423746 351 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPF2P1-201ENST00000424137 906 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 RPS20P1-201ENST00000434853 354 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC010105.1-201ENST00000437290 385 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTND1P1-201ENST00000445453 368 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MTND1P29-201ENST00000448112 647 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 EIF4A1P11-201ENST00000451239 222 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 AC233982.1-201ENST00000451247 436 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 MRPL35P4-201ENST00000453682 566 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
CCDC6Q16204 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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