Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL161734.1-201ENST00000609720 557 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MIR6798-201ENST00000612887 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CR381653.2-201ENST00000624041 768 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 PRKACB-219ENST00000614872 4306 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 GYPA-202ENST00000360771 2659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CSN3-201ENST00000304954 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RNU1-85P-201ENST00000364127 164 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LHFPL3-AS1-203ENST00000417290 950 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC017002.2-201ENST00000426124 792 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC097713.2-201ENST00000430199 356 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01078-201ENST00000434832 387 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 CLEC5A-202ENST00000438351 743 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 RPL21P133-201ENST00000443666 476 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 SPINK7-205ENST00000523535 299 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 FAM60DP-201ENST00000524174 632 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AHI1-217ENST00000534469 680 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 ZNF92P3-201ENST00000596594 954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC100793.4-201ENST00000613683 429 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 AC103798.2-201ENST00000624292 632 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 C8orf89-202ENST00000624510 658 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SNCBQ16143 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL512283.1-201ENST00000606756 1384 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIS12-201ENST00000381165 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 BAZ2B-202ENST00000343439 2364 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AIF1-202ENST00000376049 524 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 TRAJ26-201ENST00000390511 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNU4-47P-201ENST00000410876 114 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC092447.6-201ENST00000414578 210 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 HSFY4P-201ENST00000415994 1181 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC091862.1-201ENST00000438016 1100 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL354977.1-201ENST00000438147 679 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 HSFY3P-201ENST00000444242 1191 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL589963.1-201ENST00000449282 727 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RPL26P28-201ENST00000451325 435 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL031183.1-201ENST00000457667 207 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNCBQ16143 OR2A20P-203ENST00000498397 1268 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AF279873.4-202ENST00000521714 511 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNCBQ16143 DIAPH2-AS1-203ENST00000542084 450 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 OR7K1P-201ENST00000546439 926 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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SNCBQ16143 CKS1BP3-201ENST00000600888 237 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC015967.1-201ENST00000619893 476 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNVU1-3-201ENST00000364313 161 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 RNA5SP72-201ENST00000364442 117 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 LINC01851-201ENST00000443419 637 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 TPTE2P6-202ENST00000445572 1007 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AL162389.1-201ENST00000449233 177 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC093157.1-204ENST00000454721 753 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC109925.1-201ENST00000478069 331 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 CRISP1-203ENST00000505118 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC025434.1-201ENST00000520705 460 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SNCBQ16143 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
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