Protein–RNA interactions for Protein: Q16099

GRIK4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK4Q16099 RRM2B-207ENST00000519962 201 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL133279.2-201ENST00000556546 428 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC103739.1-201ENST00000558389 474 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NQO1-206ENST00000564043 892 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC018695.3-201ENST00000602617 408 ntTSL 2 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC093799.2-201ENST00000610062 578 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 DARS-AS1-225ENST00000615163 824 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CR381572.1-201ENST00000625098 102 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SLC26A5-207ENST00000393729 2422 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ADGRL2-209ENST00000370727 5164 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 GSTM2-206ENST00000442650 1478 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC01677-205ENST00000635636 2362 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AKAP6-212ENST00000557272 4601 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PCDH15-215ENST00000409834 5401 ntTSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL157938.3-201ENST00000502188 3084 ntTSL 4 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SELL-201ENST00000236147 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 VRK2-206ENST00000435505 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 C2CD6-202ENST00000439140 5512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 NPSR1-AS1-202ENST00000419766 4821 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 WDR64-201ENST00000366552 4371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LMNTD1-201ENST00000282881 1718 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PAK3-213ENST00000620137 2130 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC02397-201ENST00000504409 10626 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 WDPCP-202ENST00000398544 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 GABRA2-206ENST00000507460 5812 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 GRIA2-202ENST00000296526 5621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 DAZ1-206ENST00000620725 1891 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RGS17-202ENST00000367225 7773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RCOR3-201ENST00000367005 4246 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNA5SP90-201ENST00000364801 99 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SPRR2E-202ENST00000368751 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNU6-1151P-201ENST00000384684 107 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL354863.1-202ENST00000431695 494 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL450992.2-201ENST00000434182 506 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPS29P10-201ENST00000439197 166 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL591178.1-201ENST00000439239 454 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP1S2P1-201ENST00000457344 379 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPL21P71-201ENST00000465598 459 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC092451.1-201ENST00000480211 153 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC000372.1-201ENST00000488818 646 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC02200-202ENST00000508879 615 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC02501-201ENST00000510420 426 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC087439.1-201ENST00000517920 398 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC022360.1-201ENST00000521058 340 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 LINC01735-201ENST00000568112 279 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC007922.3-201ENST00000581648 543 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC110743.1-201ENST00000584870 478 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC008738.1-201ENST00000590117 375 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC004805.2-201ENST00000605382 482 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC087632.1-216ENST00000625619 487 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CA1-225ENST00000626824 2405 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 PEX26-201ENST00000329627 18445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL513550.1-201ENST00000418945 1638 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ZNF518B-201ENST00000326756 6894 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ZFX-211ENST00000539115 6801 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 DGKH-210ENST00000628433 3449 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AP005212.5-201ENST00000577614 3505 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CASP1-208ENST00000527979 1521 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC024337.2-201ENST00000616608 2797 ntTSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC020633.1-201ENST00000468439 2247 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 GPALPP1-201ENST00000357537 5368 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AC121333.1-201ENST00000567488 2709 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 SETD2-202ENST00000409792 8142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MSL3P1-202ENST00000440028 1468 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 THUMPD3P1-201ENST00000506556 1480 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 CEACAM1-201ENST00000161559 3519 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 ZNF382-201ENST00000292928 8329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 WDR63-201ENST00000294664 2995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 AL139276.1-201ENST00000311910 1001 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 RN7SKP103-201ENST00000363848 320 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 MEIG1-201ENST00000378240 507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
GRIK4Q16099 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.1 ms