Protein–RNA interactions for Protein: Q15929

ZNF56, Putative zinc finger protein 56, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF56Q15929 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC010745.4-201ENST00000420130 740 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC087499.2-201ENST00000432861 149 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL035706.1-201ENST00000439186 683 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 HRAT17-201ENST00000447785 547 ntTSL 4 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC104978.1-201ENST00000449387 391 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CACYBPP2-201ENST00000453625 678 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 BX510359.1-201ENST00000456973 237 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AP001992.1-205ENST00000462248 379 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 HMGB1P3-201ENST00000502802 616 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC010625.1-201ENST00000511296 403 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC010374.2-201ENST00000512933 535 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC090136.1-201ENST00000520009 240 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC090616.5-202ENST00000582111 297 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SLC35A1-205ENST00000622775 1206 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPL23AP61-201ENST00000623642 466 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 GCSAML-206ENST00000527084 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL122126.1-201ENST00000546905 1318 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 GABRG2-221ENST00000639683 3600 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CCDC158-202ENST00000434846 1728 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 OR8H1-201ENST00000313022 1038 ntAPPRIS P2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPS3AP26-201ENST00000398259 784 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC004594.1-217ENST00000422260 325 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC093843.1-201ENST00000424395 512 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MTCYBP29-201ENST00000436327 1006 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPL23AP33-201ENST00000442301 452 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPS29P26-201ENST00000477483 171 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC108748.1-201ENST00000487772 515 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC069444.1-201ENST00000489428 266 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MTCYBP41-201ENST00000528913 1123 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC007954.1-201ENST00000554198 494 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC005412.1-201ENST00000580812 1049 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MIR5092-201ENST00000583139 88 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC090772.1-201ENST00000583782 507 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC012493.2-201ENST00000595083 291 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SNORA35B-201ENST00000607417 129 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC004943.1-201ENST00000620814 561 ntTSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 PRB2-201ENST00000389362 1429 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.89□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 ANKRD36BP1-201ENST00000358576 1779 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RNU6-1077P-201ENST00000410506 102 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC009468.1-201ENST00000412800 437 ntTSL 3 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL592148.1-201ENST00000413568 445 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 LINC01709-201ENST00000415532 634 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL645937.1-202ENST00000421799 937 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 TRIM60P8Y-201ENST00000436338 762 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 ELOCP3-201ENST00000439303 348 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPL6P5-201ENST00000445678 828 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 RPL23AP31-201ENST00000456160 467 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC104472.2-201ENST00000469035 601 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC126182.1-201ENST00000478134 357 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC074131.1-201ENST00000514662 253 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 HIGD1AP18-201ENST00000520730 278 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC010306.1-201ENST00000523223 1117 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AF117829.1-209ENST00000523995 767 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC008083.2-201ENST00000546707 476 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC123904.3-201ENST00000547218 814 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC097467.3-207ENST00000602249 725 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC119501.1-201ENST00000603646 475 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC055764.2-201ENST00000610089 670 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 MANEA-201ENST00000358812 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC1.88□□□□□ -2.11
ZNF56Q15929 TAB3P1-202ENST00000452645 1634 ntBASIC1.88□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.1 ms