Protein–RNA interactions for Protein: Q15386

UBE3C, Ubiquitin-protein ligase E3C, humanhuman

Predictions only

Length 1,083 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3CQ15386 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC116003.1-202ENST00000579386 501 ntTSL 3 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 BNIP3P23-201ENST00000599655 511 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC064801.1-201ENST00000612025 407 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC244258.1-201ENST00000637553 1071 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 GMNC-201ENST00000442080 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 KCNIP4-207ENST00000509207 1301 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 IFI44L-201ENST00000370751 5874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PREPL-205ENST00000409411 4725 ntTSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 BTF3P7-201ENST00000407097 488 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL031736.2-201ENST00000426573 787 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL078581.2-201ENST00000446392 378 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC114755.5-201ENST00000447760 831 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC013269.3-201ENST00000450486 444 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC01729-201ENST00000450640 358 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LEKR1-206ENST00000483177 546 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PDLIM1P4-201ENST00000504327 1006 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RRAS2-210ENST00000534746 993 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC022509.2-201ENST00000540392 699 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC018410.2-201ENST00000540410 610 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC073651.3-201ENST00000545999 417 ntTSL 3 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC02185-201ENST00000575424 760 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC097717.1-249ENST00000608040 401 ntTSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC131902.3-201ENST00000611767 581 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC068831.8-201ENST00000620171 435 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 OR5H6-203ENST00000642105 978 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RXFP1-204ENST00000423548 3930 ntTSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 SGMS2-201ENST00000359079 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RASA1-205ENST00000512763 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 FMO2-201ENST00000209929 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 CHD9-221ENST00000615216 10603 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNU6-984P-201ENST00000363236 109 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RN7SKP226-201ENST00000364912 300 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 U8.14-201ENST00000390843 143 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 ENSAP1-201ENST00000392855 326 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 HMGB1P17-201ENST00000403495 628 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 CYP1B1-AS1-202ENST00000427168 484 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 UBXN7-204ENST00000428095 1173 ntTSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC078845.1-202ENST00000435996 733 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 CSN1S2AP-204ENST00000512167 671 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC099554.1-201ENST00000520032 572 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC084291.1-201ENST00000544667 548 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AL160314.2-204ENST00000554730 380 ntTSL 5 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 EIF5A2P1-201ENST00000564027 460 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 LINC01630-204ENST00000582689 539 ntTSL 4 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AC098614.4-201ENST00000607601 462 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 AF250324.2-201ENST00000608299 610 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 C7orf66-201ENST00000624695 435 ntTSL 2 BASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 RNA5SP196-201ENST00000625967 102 ntBASIC4.99□□□□□ -1.61
UBE3CQ15386 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC4.99□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 140 ms