Protein–RNA interactions for Protein: Q15270

NKX1-1, NK1 transcription factor-related protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 411 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-1Q15270 AL450023.1-201ENST00000450868 751 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ACA64.4-201ENST00000459070 127 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 OARD1-211ENST00000480585 829 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CDH12P4-201ENST00000517835 295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CDH12P3-201ENST00000517935 295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CDH12P1-201ENST00000518435 295 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AP006587.4-201ENST00000526053 529 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC090457.1-201ENST00000579775 211 ntTSL 3 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AP005230.1-203ENST00000582086 887 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SDR42E1P2-201ENST00000614861 481 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL807742.1-203ENST00000637444 759 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TRPC5OS-201ENST00000371970 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF737-201ENST00000427401 2867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF320-205ENST00000595635 6448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 OR2AG2-202ENST00000641124 4224 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 OR2AG2-203ENST00000641169 4221 ntAPPRIS P1 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF721-201ENST00000338977 4492 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CD86-204ENST00000469710 1604 ntTSL 2 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ZNF699-203ENST00000591998 3358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 UNC79-202ENST00000393151 7908 ntTSL 5 BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 CDK12-202ENST00000447079 8336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.56□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 D21S2088E-201ENST00000262354 1725 ntTSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL357568.1-201ENST00000421530 1963 ntTSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ERP27-201ENST00000266397 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SELE-201ENST00000333360 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 EZH1-202ENST00000428826 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 RNU6-817P-201ENST00000391083 104 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 PPP3R1-202ENST00000409377 684 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 RNU2-71P-201ENST00000411395 189 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL354824.1-201ENST00000424931 349 ntTSL 3 BASIC7.55□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 AC100832.1-201ENST00000471945 383 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC7.55□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 AC008953.1-201ENST00000497334 318 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
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NKX1-1Q15270 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AP006245.2-201ENST00000522004 300 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC103855.3-201ENST00000528445 606 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LINC01619-209ENST00000552277 571 ntTSL 4 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC127381.1-201ENST00000555979 939 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC015813.2-201ENST00000578794 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ARL2BPP3-202ENST00000580773 420 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC104687.2-201ENST00000604442 342 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 HMGB1P50-201ENST00000605814 607 ntBASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AC105265.4-201ENST00000618391 306 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 LINC00923-207ENST00000619015 505 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ALG13-202ENST00000371979 2770 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AQR-201ENST00000156471 9694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 FAM13A-AS1-201ENST00000500765 3210 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ARHGAP5-210ENST00000556611 4824 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 AL499616.1-201ENST00000415437 2633 ntTSL 2 BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 TEX41-207ENST00000445791 4635 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 SAMSN1-206ENST00000619120 2028 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 ARHGAP32-203ENST00000524655 8194 ntTSL 1 (best) BASIC7.54□□□□□ -1.2
NKX1-1Q15270 POGZ-213ENST00000491586 4130 ntTSL 5 BASIC7.54□□□□□ -1.2
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