Protein–RNA interactions for Protein: Q15262

PTPRK, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, humanhuman

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRKQ15262 LINC00632-202ENST00000498732 746 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 HAUS1P1-201ENST00000505275 832 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC023866.1-201ENST00000518064 579 ntTSL 4 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC134043.1-201ENST00000521204 638 ntTSL 3 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 MIR3186-201ENST00000577404 85 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC3.78□□□□□ -1.8
PTPRKQ15262 AC009950.2-201ENST00000636548 183 ntBASIC3.78□□□□□ -1.8
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PTPRKQ15262 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 KNTC1-205ENST00000450485 3655 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RNU6-697P-201ENST00000363348 107 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RNU4-7P-201ENST00000364758 141 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 S100G-201ENST00000380200 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC243772.1-201ENST00000451620 410 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 ERP27-202ENST00000540097 993 ntTSL 2 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 FAM106CP-201ENST00000582212 507 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC3.77□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 IGF2BP3-218ENST00000619562 2126 ntTSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AL606490.7-201ENST00000433136 191 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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PTPRKQ15262 AC079866.2-201ENST00000541870 515 ntTSL 3 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC009511.1-201ENST00000543527 191 ntTSL 5 BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
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PTPRKQ15262 AC131238.1-201ENST00000617135 328 ntBASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.76□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.75□□□□□ -1.81
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PTPRKQ15262 AC022022.1-201ENST00000430304 178 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
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PTPRKQ15262 ST13P20-201ENST00000447996 1065 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC3.75□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 LINC02143-201ENST00000519929 520 ntTSL 3 BASIC3.75□□□□□ -1.81
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PTPRKQ15262 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RPS20P25-201ENST00000412447 352 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 PTP4A1P5-201ENST00000420305 455 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AC093084.1-201ENST00000424233 687 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PTPRKQ15262 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.74□□□□□ -1.81
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PTPRKQ15262 Y_RNA.62-201ENST00000362840 99 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AFF2-IT1-201ENST00000435346 443 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 ANKRD20A9P-201ENST00000457997 2978 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 NIPA2P2-201ENST00000496376 1083 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AP001960.1-201ENST00000506494 658 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 ATF7IP2-206ENST00000543967 998 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 Metazoa_SRP.117-201ENST00000615106 292 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 ZNF93-209ENST00000638737 1020 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 BX005019.1-201ENST00000561881 1810 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 DENND4A-202ENST00000443035 8665 ntTSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
PTPRKQ15262 MBNL1-224ENST00000545754 5147 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
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