Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 EXTL2P1-201ENST00000446218 416 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AP000936.2-201ENST00000447151 681 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC093770.1-201ENST00000511559 571 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC02497-201ENST00000515292 507 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 C1DP5-201ENST00000525775 383 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC01909-202ENST00000584919 815 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 EAF1-AS1-211ENST00000610011 316 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL356274.1-201ENST00000617064 410 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 C9orf153-205ENST00000617985 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 CHD9-213ENST00000564845 11504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 CD96-203ENST00000438817 1565 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 RNA5SP99-201ENST00000364020 114 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AKAP14-202ENST00000371422 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 SNORA46-201ENST00000384762 135 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 SKINT1L-201ENST00000401057 817 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL080316.1-201ENST00000432438 499 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC01967-202ENST00000437506 515 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL035551.1-201ENST00000446931 348 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 METTL15P1-201ENST00000481421 1045 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC01218-201ENST00000515150 481 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 LINC01603-201ENST00000517343 1134 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
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CHD4Q14839 AC006116.7-201ENST00000590141 756 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 MTND5P24-201ENST00000438892 1767 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
CHD4Q14839 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL391863.2-201ENST00000411838 681 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC003092.2-201ENST00000411946 446 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL121904.1-202ENST00000416638 656 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
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CHD4Q14839 HSFY5P-201ENST00000453726 309 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC015908.1-201ENST00000478739 476 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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CHD4Q14839 AC122134.1-201ENST00000565664 1104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
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CHD4Q14839 LINC02098-202ENST00000609260 554 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
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CHD4Q14839 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 TRAV8-1-201ENST00000390430 473 ntAPPRIS P1 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC048351.1-201ENST00000420064 602 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL157387.1-201ENST00000436077 335 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CHD4Q14839 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CHD4Q14839 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MGST1-201ENST00000010404 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 MGST1-203ENST00000396207 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 CNTN4-AS2-201ENST00000447256 426 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RPL31P13-201ENST00000484151 370 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL160262.1-201ENST00000522264 254 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC107886.1-201ENST00000526935 516 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AC022166.1-201ENST00000567851 581 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
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CHD4Q14839 AL133412.1-201ENST00000380194 2992 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL445437.1-201ENST00000623157 3087 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 TMEM161BP1-201ENST00000457388 1457 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 RAD1P1-201ENST00000231383 813 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
CHD4Q14839 AL109761.1-201ENST00000428689 422 ntTSL 3 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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