Protein–RNA interactions for Protein: Q14534

SQLE, Squalene monooxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SQLEQ14534 STEAP4-201ENST00000301959 2321 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQLEQ14534 SPAG17-201ENST00000336338 6924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQLEQ14534 AC024560.2-201ENST00000507981 1497 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQLEQ14534 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SQLEQ14534 AC025164.2-202ENST00000499685 5699 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQLEQ14534 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQLEQ14534 ERMN-205ENST00000410096 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SQLEQ14534 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SNORA51.2-201ENST00000364595 132 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MIR649-201ENST00000384843 97 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL022722.2-201ENST00000402519 180 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC108032.1-201ENST00000416706 207 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC00845-201ENST00000417931 696 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC064875.1-202ENST00000421112 561 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC244098.2-201ENST00000422068 99 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL451062.2-201ENST00000427515 271 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 DIAPH3-AS2-201ENST00000428656 367 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RPL36P19-201ENST00000430744 301 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC01688-201ENST00000435492 259 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MTND2P20-201ENST00000440805 661 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CHODL-AS1-201ENST00000447175 1117 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL606519.1-201ENST00000458146 580 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL645608.2-201ENST00000458555 471 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RPL7P38-201ENST00000488396 739 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 HMGB3P15-201ENST00000507326 574 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC021146.8-201ENST00000507455 733 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC093831.1-201ENST00000509166 434 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC107463.1-202ENST00000514526 689 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SOX5-AS1-201ENST00000539583 573 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 REXO2-218ENST00000544827 880 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CFL2-206ENST00000556161 546 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL035071.2-201ENST00000565572 459 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SNORD39.3-201ENST00000584451 71 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC107982.3-201ENST00000584957 985 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MTND2P41-201ENST00000637599 773 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MIR492-201ENST00000638676 116 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CDR1-202ENST00000625883 1485 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC009975.2-201ENST00000635306 1429 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 ZNF85-201ENST00000300540 1531 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CCDC110-202ENST00000393540 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 ADGRL2-211ENST00000370730 6173 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL391417.1-201ENST00000404100 426 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL450338.1-201ENST00000407987 512 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RN7SKP33-201ENST00000410942 340 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC002075.2-201ENST00000425207 252 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SETP5-201ENST00000437270 562 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 HMGB1P12-201ENST00000438594 598 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL662791.1-201ENST00000441992 928 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC010789.1-201ENST00000458489 291 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RPL21P11-201ENST00000461458 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RPL7P18-201ENST00000478965 734 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC010587.2-201ENST00000511727 448 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 SAP18P1-201ENST00000512058 390 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC119751.5-201ENST00000514077 770 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC015468.3-201ENST00000518967 417 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC025437.3-201ENST00000523178 771 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CARD18-201ENST00000526823 627 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AP001999.2-201ENST00000529417 389 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 AC026894.1-202ENST00000533843 477 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
SQLEQ14534 LINC00944-203ENST00000542248 548 ntTSL 4 BASIC3.7□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 107.6 ms