Protein–RNA interactions for Protein: Q14055

COL9A2, Collagen alpha-2(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 689 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A2Q14055 RFPL3S-202ENST00000382086 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL136116.1-201ENST00000403591 381 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL009179.1-201ENST00000406085 265 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 FABP7P1-201ENST00000424004 391 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPL36AP53-201ENST00000432891 316 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC073264.2-201ENST00000448886 166 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL590764.1-201ENST00000450860 726 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 snoU13.1-201ENST00000459157 104 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RN7SL189P-201ENST00000468631 289 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC100773.1-201ENST00000505409 520 ntTSL 5 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 WASHC5-AS1-201ENST00000519140 587 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LYRM2-203ENST00000520318 677 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC060765.1-201ENST00000522776 544 ntTSL 4 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MS4A4E-204ENST00000526086 460 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC060780.2-201ENST00000589047 198 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC093227.2-201ENST00000589357 285 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC006254.3-201ENST00000603353 884 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 STAU2-225ENST00000523558 1603 ntTSL 2 BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 LARP4-203ENST00000398473 6427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 GPR34-201ENST00000378138 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MYB-213ENST00000525369 2866 ntTSL 1 (best) BASIC5.25□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC022893.2-201ENST00000564832 3296 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 FNIP1-201ENST00000307954 6366 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC093849.1-201ENST00000563631 2209 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF630-207ENST00000616492 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR4S2-202ENST00000641692 2211 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NRXN1-242ENST00000635519 3553 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 GTDC1-206ENST00000409214 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 INTS6P1-201ENST00000504674 2530 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 STAU2-220ENST00000522695 2646 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 SLC24A2-202ENST00000341998 10749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR5J2-201ENST00000312298 939 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 NAMPT-202ENST00000354289 1213 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR13G1-201ENST00000359688 1046 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MIR133B-201ENST00000362210 119 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU6-1249P-201ENST00000363237 111 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 Y_RNA.813-201ENST00000364639 102 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 LINC01731-201ENST00000428035 420 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL590999.1-206ENST00000437947 436 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC005008.1-201ENST00000456151 612 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC126389.1-201ENST00000477436 290 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 AL352955.1-201ENST00000555490 332 ntTSL 3 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OR7A5-202ENST00000594432 1029 ntAPPRIS P1 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC097467.3-204ENST00000595229 827 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC099669.2-201ENST00000616549 437 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 AC068631.1-223ENST00000625877 472 ntTSL 5 BASIC5.24□□□□□ -1.57
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COL9A2Q14055 AL034549.2-201ENST00000618285 3373 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 SEMA3A-201ENST00000265362 8225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ZNF615-201ENST00000376716 4048 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 TECRL-201ENST00000381210 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 DYNC1I2-225ENST00000508530 2494 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 EIF2AP4-201ENST00000424793 1781 ntBASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 DPP8-203ENST00000341861 8699 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.24□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ELAVL4-205ENST00000371824 3966 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MAPK10-304ENST00000641341 3984 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 PNISR-202ENST00000438806 3142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ETV1-207ENST00000405358 4181 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MYBPC1-209ENST00000547509 3749 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 OSBPL9P4-201ENST00000371707 1800 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 WDHD1-201ENST00000360586 5996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 FAM197Y9-201ENST00000451062 2332 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC009951.1-201ENST00000623674 2614 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 COPB2-205ENST00000507777 3034 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 STK3-216ENST00000523601 3107 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RNU4-73P-201ENST00000363164 141 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL109755.1-201ENST00000401791 649 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 ATP2B2-IT2-201ENST00000419591 507 ntTSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MORF4L2-205ENST00000423833 717 ntTSL 5 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AC108075.1-201ENST00000424692 529 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPL35AP12-201ENST00000425362 338 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 AL360227.1-201ENST00000425364 433 ntTSL 3 BASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 MTND1P14-201ENST00000427400 950 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
COL9A2Q14055 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.23□□□□□ -1.57
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