Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AL163192.1-201ENST00000448858 708 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CCDC75P1-201ENST00000469247 791 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC079380.1-201ENST00000507844 619 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC026726.1-201ENST00000512859 601 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINC01608-201ENST00000523557 544 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC091489.2-201ENST00000566263 604 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MIR3913-1-201ENST00000577744 102 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ZNF616-203ENST00000597013 577 ntTSL 4 BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 PSMA6P4-201ENST00000603247 718 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC008739.3-201ENST00000603262 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC112230.1-201ENST00000604342 547 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AP004247.3-201ENST00000608682 624 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 HNMT-202ENST00000280097 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RANBP2-201ENST00000283195 11711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 HELLS-204ENST00000371332 2675 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC026523.1-202ENST00000559363 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 TBC1D31-210ENST00000521676 3256 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AP000550.2-201ENST00000417463 774 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL672277.1-201ENST00000420865 588 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC024619.1-202ENST00000426489 495 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AP000552.3-201ENST00000434730 775 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC060834.2-201ENST00000447999 618 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 ITGA9-AS1-208ENST00000449586 726 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 OR9M1P-201ENST00000459641 921 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 TFEC-208ENST00000484212 1245 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC140847.1-201ENST00000538025 534 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC067968.2-201ENST00000592583 566 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL021997.1-201ENST00000605757 193 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC004223.4-201ENST00000612426 332 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MAGI2-AS3-224ENST00000619135 205 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CCT7-217ENST00000626868 249 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC055839.1-201ENST00000634467 498 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 GABRA1-220ENST00000638159 4088 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AK9-202ENST00000355283 2499 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNU5F-7P-201ENST00000363696 115 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 5S_rRNA.1-201ENST00000364415 116 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 MEIG1-202ENST00000407572 625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC009237.2-201ENST00000421358 284 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 BX890604.2-201ENST00000427883 474 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL512649.1-201ENST00000428997 581 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LIX1L-AS1-204ENST00000437207 222 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL365318.1-201ENST00000453128 705 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL033528.1-201ENST00000453780 140 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RPL7L1P13-201ENST00000511702 739 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC093766.1-202ENST00000513400 718 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC006499.2-201ENST00000513470 337 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 snoU109.6-201ENST00000516831 118 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC025265.2-201ENST00000551905 478 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AL139089.1-201ENST00000620372 975 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC095031.1-201ENST00000623685 672 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 KIFAP3-202ENST00000367765 4111 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC092447.7-201ENST00000422212 1621 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 DOCK7-219ENST00000635253 6423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CLEC7A-202ENST00000304084 1130 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 OR1L3-201ENST00000304820 1118 ntAPPRIS P1 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 LINC00301-201ENST00000320202 852 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 CFHR1-201ENST00000320493 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CKAP5Q14008 SNORA71.3-201ENST00000362582 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms