Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 TBCA-206ENST00000518338 551 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC105999.2-201ENST00000521363 881 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 HMGB1P1-201ENST00000522557 636 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AF279873.1-201ENST00000523393 313 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC103843.2-201ENST00000530523 682 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 CCDC179-202ENST00000532798 791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC087897.1-201ENST00000550134 156 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC015688.2-201ENST00000584523 262 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC121761.2-201ENST00000617300 689 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL158163.2-201ENST00000619110 700 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC134980.1-211ENST00000638243 1094 ntTSL 2 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SLC35A1-201ENST00000369552 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNF6-201ENST00000346166 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MTCO1P24-201ENST00000515438 1558 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL365440.1-201ENST00000436135 2167 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SUCLA2P2-201ENST00000417269 1309 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 OR4P4-201ENST00000314612 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 UTS2-202ENST00000361696 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 SNORD46.1-201ENST00000364139 104 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 CD84-204ENST00000368048 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MIR525-201ENST00000384978 85 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MTND4P22-201ENST00000413116 1169 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RPS24P7-201ENST00000416921 246 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 GRM7-AS1-201ENST00000420230 430 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC010099.3-201ENST00000423896 409 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL009174.1-201ENST00000426577 416 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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PEX6Q13608 AC098484.1-201ENST00000447572 484 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PEX6Q13608 C1orf185-202ENST00000467127 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC026414.1-201ENST00000504046 698 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 GYPA-204ENST00000504786 357 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 IL7R-204ENST00000506850 1004 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC02479-201ENST00000508942 630 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PEX6Q13608 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PEX6Q13608 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PEX6Q13608 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
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PEX6Q13608 AL121594.5-201ENST00000631724 573 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC005550.3-201ENST00000451240 3743 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 KTN1-223ENST00000555573 1712 ntTSL 2 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC01021-204ENST00000512067 1610 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 FER-201ENST00000281092 12119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MIPOL1-206ENST00000545536 2073 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 PRO1804-201ENST00000623780 2050 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RIOK3P1-201ENST00000418778 1528 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 DAOA-201ENST00000329625 1433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 AC025263.3-201ENST00000622965 1396 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.54□□□□□ -1.84
PEX6Q13608 MFSD8-233ENST00000641482 4860 ntBASIC3.54□□□□□ -1.84
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