Protein–RNA interactions for Protein: Q13515

BFSP2, Phakinin, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BFSP2Q13515 LINC02232-201ENST00000509932 4079 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC011978.2-201ENST00000569835 2054 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 NCOA1-202ENST00000348332 6895 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 RNMT-203ENST00000543302 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 EOGT-210ENST00000615922 1931 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 OR51F2-201ENST00000322110 993 ntAPPRIS ALT2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 SNORA51.6-201ENST00000384151 125 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 ARF4P3-201ENST00000397387 509 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC004160.1-205ENST00000428967 577 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AL591475.1-201ENST00000429060 489 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC096638.2-201ENST00000434965 711 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 RPL23AP83-201ENST00000434984 473 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC096558.1-202ENST00000442794 561 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC018731.1-201ENST00000447078 576 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 RC3H2-207ENST00000471874 749 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC116337.2-201ENST00000477662 156 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 NREP-AS1-202ENST00000507222 610 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC018752.1-201ENST00000507813 206 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC110792.2-201ENST00000510278 224 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC010280.3-201ENST00000515504 587 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC104316.1-201ENST00000521258 625 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC239802.1-201ENST00000531288 406 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC091516.1-201ENST00000549191 703 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC063950.1-201ENST00000552036 308 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 HSPE1P3-201ENST00000559254 309 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 LINC01584-203ENST00000567231 646 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 MIR4504-201ENST00000577413 92 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AP001004.1-201ENST00000582468 324 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC090227.2-201ENST00000591105 340 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC004987.4-201ENST00000603383 338 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC025594.3-201ENST00000613068 790 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC068722.2-201ENST00000618734 544 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 XCL1-201ENST00000367818 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 AC107029.2-201ENST00000462011 2305 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 POU2F1-204ENST00000367866 13905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 ACSM3-201ENST00000289416 2845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.69
BFSP2Q13515 OTOGL-202ENST00000458043 8083 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ERCC6-202ENST00000374127 1782 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ZNF117-203ENST00000610793 1374 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNA5SP119-201ENST00000362715 117 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNU6-1243P-201ENST00000364028 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RNU4-75P-201ENST00000364621 146 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 PLCE1-AS2-201ENST00000419353 459 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AL021026.1-201ENST00000422841 658 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC092839.2-201ENST00000431130 377 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC023590.1-204ENST00000434023 431 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 REG1CP-203ENST00000434852 460 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 GPC6-AS1-201ENST00000436329 698 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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BFSP2Q13515 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
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BFSP2Q13515 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC012158.1-204ENST00000483430 465 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC108752.1-203ENST00000496674 339 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 CBX3P3-201ENST00000508108 532 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC104057.1-201ENST00000515547 497 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ELOC-204ENST00000519487 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC026888.1-201ENST00000553348 559 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC012213.3-201ENST00000577199 777 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC012360.2-201ENST00000609349 391 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC098617.1-218ENST00000628836 624 ntTSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MBNL1-211ENST00000463374 5092 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 C21orf91-201ENST00000284881 5433 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.46□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 RABGAP1L-202ENST00000325589 1880 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC093535.2-201ENST00000624769 2326 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 MEI4-201ENST00000602452 4800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 LINC02510-201ENST00000509798 1576 ntTSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 CCDC68-201ENST00000337363 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AP001803.2-201ENST00000532274 2034 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 AC004057.1-202ENST00000356247 284 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
BFSP2Q13515 TEX43-201ENST00000357147 464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
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