Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

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Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RNU6-343P-201ENST00000364709 104 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RNA5SP22-201ENST00000365393 109 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 Z98745.1-201ENST00000402553 494 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TTTY21B-201ENST00000421353 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPL18P10-201ENST00000425606 538 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC234779.1-201ENST00000425910 285 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TTTY21-201ENST00000430228 307 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC00113-203ENST00000442550 572 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC00704-202ENST00000443994 418 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL162591.2-201ENST00000449634 317 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL354771.1-201ENST00000452178 602 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TRBV26-201ENST00000456572 344 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 GPX5-203ENST00000469384 428 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC087879.1-201ENST00000474343 374 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC098851.1-201ENST00000476561 570 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC005726.1-201ENST00000494679 427 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC112204.1-201ENST00000502591 103 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC082650.1-201ENST00000503542 575 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 PPBPP1-201ENST00000510807 373 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 HSPA8P13-201ENST00000523715 472 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AF117829.1-202ENST00000524166 836 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ASB8-204ENST00000536071 568 ntTSL 4 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 UNC13C-202ENST00000539562 938 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02490-201ENST00000559915 601 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP005205.1-201ENST00000563503 508 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MIR4715-201ENST00000584117 79 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC00907-208ENST00000593051 1092 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL157786.1-204ENST00000594870 506 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC073091.2-201ENST00000603205 907 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC005191.1-201ENST00000603950 358 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC008966.2-201ENST00000606157 453 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 PLCE1-AS2-213ENST00000620469 432 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP006248.2-201ENST00000623309 592 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SAGE2P-201ENST00000420011 2126 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP002001.2-201ENST00000529025 1469 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 CNTN6-205ENST00000446702 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 RNF13-202ENST00000361785 1939 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ZNF137P-201ENST00000456718 1920 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 KANSL1L-209ENST00000457374 2264 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC092821.1-201ENST00000640129 4180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 CASK-207ENST00000421587 8204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 DNAH8-205ENST00000449981 12940 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 KIF21A-201ENST00000361418 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AKT3-201ENST00000263826 7081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 Y_RNA.88-201ENST00000363029 99 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SRY-201ENST00000383070 845 ntAPPRIS P1 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AC012170.1-201ENST00000495139 359 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 LINC02230-201ENST00000511174 301 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AC015795.1-201ENST00000513669 327 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RN7SKP82-201ENST00000516786 223 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AF186190.1-201ENST00000517470 480 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ZNF84-205ENST00000535439 647 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
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TUBB3Q13509 AL513324.1-201ENST00000575236 632 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MIR548S-201ENST00000581352 82 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 MIR4697-201ENST00000582977 78 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TCF4-AS2-201ENST00000586467 445 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 TPMTP1-201ENST00000592307 737 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
TUBB3Q13509 RPL12P25-202ENST00000598100 674 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
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