Protein–RNA interactions for Protein: Q13434

MKRN4P, Putative E3 ubiquitin-protein ligase makorin-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKRN4PQ13434 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNA5SP280-201ENST00000411230 115 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 GAS5-208ENST00000425771 242 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 GEMIN2P1-201ENST00000454246 752 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OR2A1-AS1-202ENST00000467944 422 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL591122.1-201ENST00000487348 492 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC146944.3-201ENST00000509969 371 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC092674.1-201ENST00000513871 571 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC016598.2-201ENST00000514942 525 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC120036.3-201ENST00000517826 292 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 IDH3A-223ENST00000561366 389 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CTSLP2-201ENST00000580501 394 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC105265.3-202ENST00000610188 459 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RN7SL126P-201ENST00000616400 299 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SLC7A14-201ENST00000231706 10103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 PPP4R3CP-201ENST00000412172 3131 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 BANK1-203ENST00000444316 3141 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MAPK10-261ENST00000641050 3109 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 TEK-202ENST00000406359 3935 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 DLG2-211ENST00000426717 5927 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 TNPO1-204ENST00000506351 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MAPRE2-203ENST00000436190 4323 ntTSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 DIAPH3-208ENST00000498416 2249 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SMG1P7-201ENST00000565246 2704 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LIN28B-201ENST00000345080 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CTAGE5-201ENST00000280082 2554 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MAGT1-201ENST00000358075 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF260-202ENST00000523638 5666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LARS-212ENST00000510191 3737 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 OR2A5-202ENST00000641693 8681 ntAPPRIS P1 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 HMG20A-202ENST00000381714 4112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL353133.1-201ENST00000407695 401 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIR1266-201ENST00000408125 84 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SPATA20P1-201ENST00000423089 438 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC068888.2-201ENST00000435621 536 ntTSL 3 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC108161.1-201ENST00000461060 402 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RN7SL160P-201ENST00000468558 284 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC098818.1-201ENST00000478593 252 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ASB8-207ENST00000536953 923 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIR5582-201ENST00000579697 68 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 POU2F2-219ENST00000625670 371 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ACOT13-201ENST00000230048 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 USP46-202ENST00000451218 4622 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SLA-201ENST00000338087 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SLC22A25-201ENST00000306494 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF793-207ENST00000587986 3869 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC245407.1-201ENST00000621489 2538 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 JAM3-202ENST00000441717 3363 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MEF2C-254ENST00000637732 3347 ntTSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ADGRL3-207ENST00000507625 4843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SLC15A2-205ENST00000489711 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 USP1-202ENST00000371146 3507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SYNPO2-202ENST00000429713 9920 ntTSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF148-201ENST00000360647 9651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 FCHSD2-201ENST00000311172 4340 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SMC2-202ENST00000374787 4266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 STT3A-214ENST00000531491 2160 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 NPHP1-201ENST00000316534 3756 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC064875.1-201ENST00000425974 1942 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ARHGAP42P4-201ENST00000549782 2934 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 BEST3-202ENST00000330891 3532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ETS1-202ENST00000392668 5139 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 LINC01360-203ENST00000440762 3871 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ENPP5-202ENST00000371383 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL136100.1-201ENST00000407696 330 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RPL7AP25-201ENST00000423357 805 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RPEP4-201ENST00000437636 602 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 RN7SL797P-201ENST00000486314 297 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AC009567.2-201ENST00000502989 349 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MIR4312-201ENST00000579909 76 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL359091.2-201ENST00000609303 556 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 HOXA11-AS1_3.1-201ENST00000613383 98 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AL354798.1-201ENST00000622505 329 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AP001340.1-201ENST00000624405 217 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 NCKAP5-203ENST00000405974 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 MSR1-202ENST00000350896 3572 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 AP000432.2-201ENST00000624164 2048 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ITGA1-201ENST00000282588 10757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 CLCA1-202ENST00000394711 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ETV1-201ENST00000242066 6348 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ZNF486-201ENST00000335117 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 ANK2-215ENST00000509550 3638 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
MKRN4PQ13434 UBAP2-201ENST00000360802 4284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
MKRN4PQ13434 TTTY2-201ENST00000417072 3168 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms