Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 KLRC2-206ENST00000619500 883 ntTSL 5 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC067852.7-201ENST00000623270 535 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 POPDC3-201ENST00000254765 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SNORD88.1-201ENST00000408684 91 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC107081.1-201ENST00000414975 361 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL513175.2-201ENST00000422071 443 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC106901.1-201ENST00000425086 698 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 LINC01817-201ENST00000429317 564 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RPL36AP33-201ENST00000450395 310 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 SLC7A11-AS1-201ENST00000510066 817 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC093297.1-201ENST00000511712 591 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC003973.1-201ENST00000600071 546 ntTSL 4 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.73□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 GABRG2-215ENST00000639213 9960 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 ARHGAP28-202ENST00000314319 5415 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 NEDD4-208ENST00000508342 7235 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AJ009632.2-202ENST00000634644 1513 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 MTND5P27-201ENST00000428871 1720 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 WHAMMP2-201ENST00000512149 5482 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 NEDD1-204ENST00000457368 3162 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 NCSTNP1-201ENST00000406229 144 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AIMP1P1-201ENST00000418670 937 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 UBE2V2P4-201ENST00000447495 259 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 FBXO3-210ENST00000532057 918 ntTSL 2 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 MYL12A-202ENST00000536605 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 CKS1BP1-201ENST00000555221 240 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 DISC1FP1-203ENST00000562678 796 ntTSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 MYL12A-209ENST00000580887 899 ntTSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 GMCL1P2-201ENST00000605230 823 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AC069528.2-201ENST00000624849 1991 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.72□□□□□ -1.81
TCOF1Q13428 AL138828.1-203ENST00000419926 1570 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 VN1R17P-201ENST00000472048 1090 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AL049830.2-201ENST00000480072 201 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 MTND4P2-201ENST00000507767 1203 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC008716.1-201ENST00000511084 513 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 PPP1R42-212ENST00000522909 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
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TCOF1Q13428 ATXN3L-202ENST00000622204 837 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 MIR1291-201ENST00000627649 87 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 MGA-207ENST00000566586 14439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC098798.1-201ENST00000503998 1447 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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TCOF1Q13428 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC098583.1-201ENST00000480875 255 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 POU5F1P7-201ENST00000508759 541 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 VTA1P2-201ENST00000520205 911 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AL445363.2-202ENST00000555361 435 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 PSMG2-204ENST00000585331 983 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC072062.1-205ENST00000595058 962 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 FBXL13-204ENST00000436908 2577 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 MRRF-203ENST00000373723 1176 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 UQCRFS1P3-201ENST00000407697 385 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AL645634.2-201ENST00000431956 411 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 HMGN1P5-201ENST00000448591 263 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC022884.3-201ENST00000579571 248 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 NRBF2P1-201ENST00000587407 859 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 AC068313.1-201ENST00000604028 1008 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
TCOF1Q13428 SNORD114-30-201ENST00000364448 72 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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