Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC006270.1-201ENST00000582889 478 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC01791-201ENST00000589511 677 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC011518.1-202ENST00000592668 407 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC103881.1-201ENST00000603476 538 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SNORA51-201ENST00000606420 132 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MIR6748-201ENST00000610433 71 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC109454.4-201ENST00000623411 649 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MKKS-204ENST00000639674 192 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ZNF663P-202ENST00000641770 1131 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 PCDH11Y-201ENST00000215473 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 DOCK7-202ENST00000340370 6731 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 PPP1R12A-204ENST00000546369 2977 ntTSL 2 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GPR18-203ENST00000397473 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 DAZ4-201ENST00000382296 2048 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MTCO1P23-201ENST00000415223 1526 ntBASIC2.63□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 DTHD1-205ENST00000507598 2606 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU1-75P-201ENST00000347264 129 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 COX7B2-201ENST00000355591 542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RFX3-203ENST00000381984 364 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MIR122-201ENST00000385044 85 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 GPC5-AS1-201ENST00000419288 393 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL646090.1-201ENST00000449928 492 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL023581.2-201ENST00000454588 552 ntTSL 2 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RN7SL442P-201ENST00000473804 320 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RN7SL132P-201ENST00000478131 296 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC113420.1-201ENST00000507903 571 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC026402.1-201ENST00000513642 170 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 FABP5P12-201ENST00000515543 389 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC109466.1-204ENST00000519570 717 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MED28P5-201ENST00000528254 438 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC008127.2-201ENST00000549925 1075 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL355073.1-201ENST00000560296 517 ntTSL 4 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC046158.1-201ENST00000563408 719 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 BLOC1S6-207ENST00000565216 573 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MMP2-AS1-202ENST00000569037 553 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MIR4700-201ENST00000578311 74 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC011509.1-201ENST00000589512 164 ntTSL 3 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL022097.1-201ENST00000602500 806 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL365400.2-201ENST00000605604 902 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC090912.3-201ENST00000609775 533 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AL109620.1-201ENST00000618738 1197 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC069209.1-201ENST00000619282 651 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC009269.6-201ENST00000621778 588 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC006963.1-201ENST00000624003 1052 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 FLG-AS1-207ENST00000628475 497 ntTSL 5 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OR2M2-202ENST00000641211 1229 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 OR2M2-203ENST00000641836 1151 ntAPPRIS P1 BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 APAF1-208ENST00000549007 3492 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ZNF404-201ENST00000324394 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ATP2B1-203ENST00000393164 3127 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 C6orf10-203ENST00000442822 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 CCDC169-201ENST00000239859 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 ZNF679-201ENST00000255746 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU4-51P-201ENST00000364206 140 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 CCDC169-203ENST00000379862 624 ntTSL 5 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 SNORA48.8-201ENST00000391324 134 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 AC069280.1-201ENST00000413094 439 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 UBE2Q2P5Y-201ENST00000413867 207 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
ERCC8Q13216 RPS7P13-201ENST00000413955 498 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.3 ms