Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 LINC02562-201ENST00000561705 785 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AMZ2-204ENST00000577273 895 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RN7SL339P-201ENST00000580597 296 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC004147.1-201ENST00000580658 299 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC012417.1-201ENST00000582307 1039 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC01533-202ENST00000588694 632 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC013444.2-201ENST00000603317 787 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC021749.1-201ENST00000604322 607 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC004853.1-201ENST00000604902 698 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC097504.2-201ENST00000608088 454 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AF129408.1-201ENST00000608767 431 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PART1_2.1-201ENST00000612397 250 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PRKACB-202ENST00000370682 4288 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PRKACB-208ENST00000394839 4200 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ADGRG2-206ENST00000360279 4702 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTRNR2L13-201ENST00000604093 1445 ntAPPRIS P1 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 USP33-201ENST00000357428 4155 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MUC7-203ENST00000456088 2479 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.43□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 USP15-203ENST00000353364 14950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNA5-8SP7-201ENST00000363443 155 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SNORD35B-201ENST00000363660 87 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 IGKV5-2-201ENST00000390244 408 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LGALS16-201ENST00000392051 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC011933.1-201ENST00000413334 321 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SSXP9-201ENST00000417503 292 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC022537.1-201ENST00000435271 446 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL23AP24-201ENST00000458203 385 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC116533.1-201ENST00000459748 321 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPS3AP50-201ENST00000487064 803 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC013356.1-201ENST00000489027 564 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC096571.1-202ENST00000506634 735 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC114322.1-201ENST00000506771 926 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LEF1-218ENST00000512172 598 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PIH1D2-206ENST00000528775 1025 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC022240.1-201ENST00000532065 684 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC02286-201ENST00000552425 285 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL132657.2-201ENST00000564417 358 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL032819.1-201ENST00000568554 379 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR4K8P-201ENST00000578842 1048 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 BNIP3P11-201ENST00000603878 563 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC016877.3-201ENST00000606778 504 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LRRC2-AS1-202ENST00000614743 633 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL596245.1-201ENST00000618994 362 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 PACRG-211ENST00000621363 360 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC022509.4-201ENST00000621404 572 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 CNGA1-203ENST00000420489 2746 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 IQCH-206ENST00000546225 3112 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ZNF639-206ENST00000484866 1730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MTUS1-228ENST00000544260 3650 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TMPRSS11A-202ENST00000508048 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ZNF883-201ENST00000619044 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DEFB108B-201ENST00000328698 222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR30E-201ENST00000362104 92 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LY6G5C-210ENST00000383237 674 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 Y_RNA.408-201ENST00000383987 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TRAV7-201ENST00000390429 337 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPS4XP3-201ENST00000398541 413 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TANK-203ENST00000402568 878 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 MIR1251-201ENST00000408552 70 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNA5SP36-201ENST00000410197 133 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNU2-43P-201ENST00000410306 190 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL691426.1-201ENST00000416507 509 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 HSPE1P1-201ENST00000421494 318 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 DIAPH3-AS1-201ENST00000422052 428 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 TMEM167AP1-201ENST00000423409 219 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 OR8F1P-201ENST00000425243 930 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 ZMYM4-AS1-201ENST00000432683 459 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 AC024082.2-201ENST00000434771 238 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
CBX3Q13185 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
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