Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC022118.1-201ENST00000512352 547 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC008700.1-201ENST00000512571 654 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 ABCA17P-206ENST00000512848 467 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SNORA31.8-201ENST00000516327 108 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC009292.2-201ENST00000558889 291 ntTSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CERS3-AS1-202ENST00000560718 432 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC018767.1-201ENST00000566236 405 ntTSL 3 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC245036.5-201ENST00000596330 847 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP001330.4-201ENST00000604350 154 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL356863.1-201ENST00000623378 1080 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC104985.3-201ENST00000623479 597 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 NPSR1-AS1-205ENST00000436945 1406 ntTSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CD36-221ENST00000534394 1741 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR5H2-201ENST00000355273 945 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR5H2-202ENST00000356526 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNU1-18P-201ENST00000363062 164 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPL21P17-201ENST00000397467 475 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RNU2-42P-201ENST00000410697 113 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 ATP5A1P2-201ENST00000412323 255 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 OR4K6P-201ENST00000416478 897 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPL21P109-201ENST00000422213 475 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC008067.1-203ENST00000430876 359 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC005208.1-201ENST00000435112 599 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC122718.1-201ENST00000439448 744 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP002512.3-201ENST00000440231 985 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC009950.1-206ENST00000445199 517 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 Z95327.1-201ENST00000446082 482 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPL39P6-201ENST00000448289 150 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPS3AP46-201ENST00000448352 682 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 FAM133DP-201ENST00000464802 691 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RN7SL542P-201ENST00000467147 294 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 RPS23P3-201ENST00000470993 430 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC013509.1-201ENST00000524269 339 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 KLRF1-203ENST00000537723 598 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL391156.1-201ENST00000554965 554 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 MIR4474-201ENST00000579189 78 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC024603.1-201ENST00000597938 592 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC096947.1-201ENST00000603233 470 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 CYCSP41-201ENST00000616920 296 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AC123767.1-202ENST00000620407 817 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 AL732618.1-201ENST00000623251 301 ntBASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 LINC01002-206ENST00000631772 539 ntTSL 4 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 UGT2B10-201ENST00000265403 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 ARF4-206ENST00000489843 1360 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.83
RPA4Q13156 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 WDFY3-AS2-202ENST00000451762 5814 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TTC41P-203ENST00000548527 1475 ntTSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 FRYL-205ENST00000503238 11103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 FKTN-209ENST00000602661 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 OR6C2-201ENST00000322678 939 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TTTY13-201ENST00000330337 659 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RNU5D-1-201ENST00000363299 116 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 snoZ40.1-201ENST00000364540 72 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TXNDC8-202ENST00000374510 455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPL21P32-201ENST00000419877 477 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC245054.1-201ENST00000420944 258 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 MRPS36P1-201ENST00000421291 307 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TXNDC8-204ENST00000423740 356 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL590302.1-201ENST00000431017 359 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AL138900.2-201ENST00000434098 156 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 HMGB3P6-201ENST00000444896 598 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 CDC27P1-201ENST00000445384 715 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 SUMO2P2-201ENST00000456482 255 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC097521.1-201ENST00000505488 567 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC096577.1-203ENST00000506386 541 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC097480.1-201ENST00000509416 712 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
RPA4Q13156 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.8 ms