Protein–RNA interactions for Protein: Q13077

TRAF1, TNF receptor-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF1Q13077 RNU6-317P-201ENST00000384031 107 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TRAJ16-201ENST00000390521 60 ntAPPRIS P1 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 SNORA48.7-201ENST00000391302 135 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC000123.1-201ENST00000418215 516 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 DNAJA1P2-201ENST00000421360 1197 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TTC3-AS1-201ENST00000424733 1097 ntTSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 Z93242.1-201ENST00000427102 353 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL445584.1-201ENST00000431451 330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC00595-203ENST00000432742 683 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 LINC00415-201ENST00000439079 435 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL591503.2-201ENST00000442314 1005 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC091564.1-201ENST00000464563 479 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ACTR3P3-201ENST00000480448 893 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC080014.1-201ENST00000496877 1201 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 TEMN3-AS1-201ENST00000510211 401 ntTSL 3 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC108471.1-201ENST00000513977 287 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RNU6-1225P-201ENST00000516336 65 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MMP2-AS1-201ENST00000565307 593 ntTSL 4 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC006539.2-201ENST00000601729 572 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 CT45A5-202ENST00000617203 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC018926.3-201ENST00000618841 406 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC110491.2-201ENST00000624061 646 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AL391597.2-201ENST00000635698 479 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 ANKRD20A17P-201ENST00000511745 1330 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 Z99496.1-201ENST00000469424 1477 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 AC087359.1-201ENST00000508335 1740 ntBASIC4.34□□□□□ -1.71
TRAF1Q13077 RAD51AP1-201ENST00000228843 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AGL-206ENST00000370165 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 WNK3-205ENST00000620763 5400 ntTSL 5 BASIC4.34□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 TIGD2-201ENST00000317005 2083 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 OXR1-201ENST00000297447 1944 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 GABPB1-204ENST00000396464 1401 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL390237.1-201ENST00000404226 1415 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC109315.1-201ENST00000584143 1347 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 DPP10-204ENST00000409163 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RNU6-839P-201ENST00000363347 108 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 GRK5-IT1-201ENST00000421206 400 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 OFD1P2Y-201ENST00000421895 1149 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL022400.1-201ENST00000423946 935 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AP001599.1-201ENST00000426771 361 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC244035.1-201ENST00000430042 390 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MTCO3P21-201ENST00000430791 643 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC093155.1-201ENST00000440164 826 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL034418.1-201ENST00000448675 860 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 ETV5-AS1-201ENST00000453370 560 ntTSL 4 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MDM2-217ENST00000478070 692 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 VPS13A-211ENST00000484581 1155 ntTSL 2 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC109349.1-201ENST00000503299 758 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC147055.4-201ENST00000504399 745 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC112198.1-201ENST00000505369 1220 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC008885.2-201ENST00000509506 930 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RNU6-678P-201ENST00000516832 109 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 RNA5SP135-201ENST00000517019 125 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AKIRIN1P1-201ENST00000547384 544 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC090751.1-201ENST00000566966 267 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 INTS6-AS1-210ENST00000595424 301 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC119751.7-201ENST00000600494 245 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 LINC00310-206ENST00000609947 892 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 uc_338.9-201ENST00000617424 182 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 SATB1-AS1-269ENST00000630766 591 ntTSL 5 BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC116618.1-201ENST00000634617 774 ntBASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 DST-201ENST00000244364 16742 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MUC7-201ENST00000304887 2443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 GPRC6A-203ENST00000530250 2310 ntTSL 1 (best) BASIC4.33□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 TFEC-201ENST00000265440 6628 ntTSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CPB2-201ENST00000181383 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 MTND4P34-201ENST00000572715 1371 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 OR2AP1-201ENST00000321688 930 ntAPPRIS P1 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 Y_RNA.311-201ENST00000365068 96 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 CXorf65-201ENST00000374251 601 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AC068295.1-201ENST00000413056 153 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC4.32□□□□□ -1.72
TRAF1Q13077 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.32□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.4 ms