Protein–RNA interactions for Protein: Q13061

TRDN, Triadin, humanhuman

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Length 729 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRDNQ13061 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.45□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 PABPC1P7-201ENST00000413177 1513 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 BX248415.1-201ENST00000367421 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL592114.1-201ENST00000403842 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU4-65P-201ENST00000410473 140 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC051618.1-201ENST00000414295 207 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC013476.1-201ENST00000446709 537 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SLC16A12-AS1-202ENST00000454270 478 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC011979.1-201ENST00000472300 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL21P93-201ENST00000480465 489 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC233702.1-201ENST00000482905 502 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 ENSA-210ENST00000503241 574 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC008780.2-201ENST00000509844 820 ntTSL 2 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC022679.1-202ENST00000520251 376 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AP004371.1-201ENST00000525240 214 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL590385.2-201ENST00000537821 553 ntTSL 5 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC073487.1-201ENST00000547009 529 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL132780.1-202ENST00000548322 591 ntTSL 4 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SETP2-201ENST00000553886 926 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC007566.2-201ENST00000603642 413 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC010894.2-203ENST00000606406 499 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 VIS1.1-201ENST00000610517 203 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC009039.2-201ENST00000624524 529 ntBASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 ZRANB2-201ENST00000254821 2821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC3.44□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU6-1293P-201ENST00000384077 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL121972.1-201ENST00000402023 252 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LINC01201-201ENST00000412420 294 ntTSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC008280.1-201ENST00000418851 412 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 PATE1-202ENST00000437148 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 CYCSP32-201ENST00000440548 321 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 CASP12-207ENST00000447913 819 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 NANOGNBP1-201ENST00000448444 480 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 Z99714.1-201ENST00000450463 807 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 TBL1XR1-AS1-201ENST00000454723 414 ntTSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 KLHL6-AS1-201ENST00000491676 503 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC093725.2-201ENST00000507808 356 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
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TRDNQ13061 POLR2KP1-201ENST00000553226 168 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC009268.1-201ENST00000561352 1203 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
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TRDNQ13061 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU6-156P-201ENST00000621869 107 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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TRDNQ13061 AC108206.1-201ENST00000570186 4159 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
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TRDNQ13061 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 CLEC4A-201ENST00000229332 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRDNQ13061 TOMM22P1-201ENST00000418578 312 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AL592437.1-201ENST00000443781 492 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RPL21P41-201ENST00000459863 264 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
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TRDNQ13061 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LINC02364-201ENST00000514802 687 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SNORA74D-201ENST00000516404 141 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 COX6B1P6-201ENST00000522347 255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC084819.1-201ENST00000537293 424 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 MIR3200-201ENST00000580767 85 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC073111.2-201ENST00000605657 1075 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RASSF8-215ENST00000611440 852 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 INPP4B-223ENST00000630044 354 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 NPY5R-202ENST00000506953 1418 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 KIAA0825-203ENST00000513200 4942 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 DCLRE1A-202ENST00000369305 4241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 GNG5P1-201ENST00000255500 204 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU1-35P-201ENST00000362782 153 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RNU4-23P-201ENST00000362839 140 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 MTCO3P4-201ENST00000419236 787 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 RFESDP1-201ENST00000422350 461 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 LINC00400-201ENST00000425609 547 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 XKRYP6-201ENST00000440468 1116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TRDNQ13061 XKRYP3-201ENST00000442113 1116 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
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