Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RPS27L-202ENST00000411926 528 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RPL31P2-201ENST00000413849 377 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 LINC01878-201ENST00000434559 769 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AL589684.1-201ENST00000445974 507 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RPL37P6-202ENST00000464216 403 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 DWORF-201ENST00000489090 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 AC078918.1-201ENST00000498515 228 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC111193.1-201ENST00000504097 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 MTND4LP22-201ENST00000508209 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC005351.1-201ENST00000511152 786 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 LINC01088-208ENST00000511895 795 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RNU4-60P-201ENST00000517239 135 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC078889.1-201ENST00000536412 523 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 AF099810.1-201ENST00000554219 525 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 GNG2-205ENST00000554736 569 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 C16orf97-203ENST00000566314 281 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC110792.4-201ENST00000609843 298 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC092442.1-201ENST00000636216 138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 LINC02516-201ENST00000563724 1771 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 XRN1-202ENST00000392981 5383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC100800.1-201ENST00000524252 2054 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 ZNF66-201ENST00000344519 1745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 MS4A5-201ENST00000300190 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 AP004607.9-201ENST00000618202 316 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 C17orf112-201ENST00000623702 835 ntTSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 CENPK-201ENST00000242872 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC072062.1-210ENST00000628464 1315 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 FOXP2-211ENST00000408937 6443 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 DNAJC2-201ENST00000249270 1846 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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FOXF1Q12946 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 MTND2P16-201ENST00000419987 799 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AL831737.1-201ENST00000441288 271 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 AC020559.1-201ENST00000444229 583 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
FOXF1Q12946 RSL24D1P2-201ENST00000445584 366 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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