| FOXF1 | Q12946 | MTND4P13-201 | ENST00000402078 | 1023 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPS27L-202 | ENST00000411926 | 528 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPL31P2-201 | ENST00000413849 | 377 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | COTL1P1-201 | ENST00000422309 | 375 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL590623.1-201 | ENST00000427864 | 105 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | LINC01878-201 | ENST00000434559 | 769 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | SETP8-201 | ENST00000435341 | 628 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPL39P40-201 | ENST00000445481 | 146 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL589684.1-201 | ENST00000445974 | 507 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | NRG3-AS1-201 | ENST00000448936 | 555 nt | TSL 2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | snoU13.24-201 | ENST00000458998 | 104 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPL37P6-202 | ENST00000464216 | 403 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPL21P8-201 | ENST00000465083 | 535 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC107398.1-201 | ENST00000486904 | 505 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | DWORF-201 | ENST00000489090 | 873 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC069444.1-201 | ENST00000489428 | 266 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC078918.1-201 | ENST00000498515 | 228 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC111193.1-201 | ENST00000504097 | 155 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC097462.2-201 | ENST00000504623 | 481 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC016933.1-201 | ENST00000504735 | 539 nt | TSL 2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC090071.1-201 | ENST00000507713 | 644 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | MTND4LP22-201 | ENST00000508209 | 276 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC005351.1-201 | ENST00000511152 | 786 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | LINC01088-208 | ENST00000511895 | 795 nt | TSL 2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RNU6-751P-201 | ENST00000516382 | 101 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | SNORA9.3-201 | ENST00000516383 | 129 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RNA5SP367-201 | ENST00000516557 | 118 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RNU4-60P-201 | ENST00000517239 | 135 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC078889.1-201 | ENST00000536412 | 523 nt | TSL 2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC091814.1-201 | ENST00000545258 | 719 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC108721.1-201 | ENST00000547088 | 348 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AF099810.1-201 | ENST00000554219 | 525 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | GNG2-205 | ENST00000554736 | 569 nt | APPRIS P1 TSL 4 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | C16orf97-203 | ENST00000566314 | 281 nt | TSL 3 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL033523.1-201 | ENST00000605153 | 153 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL160281.1-201 | ENST00000605307 | 311 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC005046.1-201 | ENST00000608515 | 625 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC110792.4-201 | ENST00000609843 | 298 nt | BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC092442.1-201 | ENST00000636216 | 138 nt | APPRIS P1 TSL 5 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | LINC02516-201 | ENST00000563724 | 1771 nt | TSL 2 BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | XRN1-202 | ENST00000392981 | 5383 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 2.5 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC100800.1-201 | ENST00000524252 | 2054 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | ASNSP3-201 | ENST00000451989 | 1306 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | ZNF66-201 | ENST00000344519 | 1745 nt | APPRIS P1 TSL 3 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | MGAT4C-211 | ENST00000621808 | 2582 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | MS4A5-201 | ENST00000300190 | 722 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL138827.1-201 | ENST00000402666 | 306 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | XKRYP4-201 | ENST00000414395 | 483 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL596247.1-201 | ENST00000416076 | 442 nt | TSL 3 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL122034.1-201 | ENST00000427609 | 497 nt | TSL 2 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC105272.1-201 | ENST00000438604 | 198 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | HSPE1P28-201 | ENST00000443139 | 211 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | ARL5AP2-201 | ENST00000444698 | 533 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL078581.2-201 | ENST00000446392 | 378 nt | TSL 3 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | XKRYP5-201 | ENST00000449659 | 483 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | HGF-207 | ENST00000453018 | 721 nt | TSL 3 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | IFT74-AS1-201 | ENST00000456198 | 405 nt | TSL 2 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RPL9P33-201 | ENST00000484311 | 566 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | ATP6V1G3-204 | ENST00000489986 | 449 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | LINC02049-201 | ENST00000490647 | 747 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | TMEM248P1-201 | ENST00000510579 | 951 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC104986.1-201 | ENST00000517978 | 436 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AP001207.1-201 | ENST00000524051 | 481 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RGS4-207 | ENST00000527809 | 817 nt | TSL 4 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC090092.1-201 | ENST00000530576 | 510 nt | TSL 2 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | OR8L1P-201 | ENST00000534005 | 955 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC009509.2-201 | ENST00000538640 | 429 nt | TSL 2 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC007954.1-201 | ENST00000554198 | 494 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC067805.1-201 | ENST00000559344 | 470 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC026462.2-201 | ENST00000565771 | 286 nt | TSL 2 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC005951.1-201 | ENST00000576706 | 485 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | LARP7P3-201 | ENST00000579888 | 337 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | MIR3605-201 | ENST00000583214 | 100 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC022706.1-202 | ENST00000585387 | 540 nt | TSL 3 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC100814.1-201 | ENST00000606963 | 623 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | CEP164P1-207 | ENST00000608660 | 504 nt | TSL 5 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC107871.2-201 | ENST00000612894 | 502 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AP004607.9-201 | ENST00000618202 | 316 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | C17orf112-201 | ENST00000623702 | 835 nt | TSL 2 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC104820.1-201 | ENST00000624183 | 307 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | DLD-214 | ENST00000639772 | 421 nt | TSL 5 BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC002546.1-201 | ENST00000588041 | 2504 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | SIRT1-202 | ENST00000403579 | 3333 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL161431.1-201 | ENST00000618966 | 4205 nt | BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | CENPK-201 | ENST00000242872 | 1576 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.49 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC072062.1-210 | ENST00000628464 | 1315 nt | TSL 5 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | FOXP2-211 | ENST00000408937 | 6443 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | DNAJC2-201 | ENST00000249270 | 1846 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | OR8K5-201 | ENST00000313447 | 924 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | TEX43-201 | ENST00000357147 | 464 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | TRAV26-1-201 | ENST00000390455 | 537 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL512633.1-201 | ENST00000399931 | 655 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL355379.1-201 | ENST00000405542 | 640 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | MTND2P16-201 | ENST00000419987 | 799 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | LINC01884-201 | ENST00000433429 | 440 nt | TSL 3 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC000041.1-201 | ENST00000439655 | 175 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AL831737.1-201 | ENST00000441288 | 271 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | U91324.1-201 | ENST00000442864 | 447 nt | TSL 5 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | AC020559.1-201 | ENST00000444229 | 583 nt | TSL 2 BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |
| FOXF1 | Q12946 | RSL24D1P2-201 | ENST00000445584 | 366 nt | BASIC | 2.48 | □□□□□ -2.01 | | |