Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 AF181450.1-201ENST00000522980 410 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SUB1P1-201ENST00000524415 382 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AP001804.2-201ENST00000533932 910 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC016526.2-201ENST00000554225 520 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC005244.2-201ENST00000585228 718 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPL26P30-202ENST00000602923 645 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC022017.1-201ENST00000608793 559 ntTSL 4 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ARHGAP28-205ENST00000531294 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 NTRK3-205ENST00000394480 19984 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC5.81□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNF213-204ENST00000508628 17730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ATRX-202ENST00000395603 10218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TPTE2-203ENST00000390680 1558 ntTSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ZNF677-201ENST00000333952 3422 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RRP15-201ENST00000366932 7771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SLC13A1-201ENST00000194130 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 DNA2-201ENST00000358410 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 R3HDM1-204ENST00000410054 4442 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 ATF2-221ENST00000538946 1325 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 SYTL2-204ENST00000389958 1943 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TMEM68-202ENST00000434581 2549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC140134.1-201ENST00000511830 3544 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 OR5A2-203ENST00000641673 9444 ntAPPRIS P1 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LCA5L-203ENST00000380671 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 APOA2-201ENST00000367990 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL049697.2-201ENST00000403708 294 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RN7SKP266-201ENST00000410232 287 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 AC012181.1-201ENST00000479895 423 ntBASIC5.8□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 CCDC178-211ENST00000581852 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 LINC00706-201ENST00000628989 699 ntTSL 3 BASIC5.8□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 ADGRL2-222ENST00000627151 5789 ntTSL 5 BASIC5.8□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 EIF2AK3-203ENST00000419748 4222 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 ACTR3BP2-202ENST00000623630 1338 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.79□□□□□ -1.48
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NFIAQ12857 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TRAV26-2-201ENST00000390460 327 ntAPPRIS P1 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RN7SKP16-201ENST00000410180 299 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU6-985P-201ENST00000410182 104 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 TTTY12-201ENST00000413466 979 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC114755.2-201ENST00000413520 361 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC234782.4-201ENST00000417646 1048 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 UBE2V1P5-201ENST00000440070 405 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AL136380.1-201ENST00000447970 162 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 RPS24P6-201ENST00000452670 400 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC078785.3-201ENST00000476607 425 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 LINC01181-201ENST00000503718 556 ntTSL 4 BASIC5.79□□□□□ -1.48
NFIAQ12857 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC5.79□□□□□ -1.48
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