Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 PATE4-201ENST00000457514 1983 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 IFT52-202ENST00000373039 1599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC132825.1-201ENST00000463573 2247 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 OTUD4-202ENST00000454497 7069 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 KLHL28-201ENST00000355081 2177 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SPRR2D-201ENST00000360379 682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 Y_RNA.273-201ENST00000364703 102 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 HMGB1P20-201ENST00000402555 677 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MIR320C1-201ENST00000408566 88 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 GPS2P1-201ENST00000411761 986 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC093716.1-201ENST00000435923 377 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RPL7P28-201ENST00000437739 740 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 LINC01307-201ENST00000439146 474 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MTCO1P27-201ENST00000448269 226 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RN7SL188P-201ENST00000469842 285 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RN7SL583P-201ENST00000475692 287 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC108860.1-201ENST00000484521 383 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC008517.1-201ENST00000502383 585 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC079226.2-201ENST00000509283 518 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP002383.3-201ENST00000545958 593 ntTSL 4 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MACROD2-IT1-202ENST00000605675 575 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC010149.2-201ENST00000637608 315 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 LINC01222-201ENST00000427439 1785 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ZNF701-202ENST00000391785 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ZNF492-201ENST00000456783 4245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 FAM19A2-215ENST00000551619 2718 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ATF2-202ENST00000345739 4079 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 TCF7L2-206ENST00000355995 4073 ntTSL 1 (best) BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC144833.1-201ENST00000567953 4089 ntBASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 KBTBD8-201ENST00000417314 4680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 DCDC1-203ENST00000406071 4758 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 GABRA1-218ENST00000637827 1838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.02□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ELMO1-203ENST00000396045 2524 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RFX3-204ENST00000382004 9307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 XPOTP1-201ENST00000443317 2398 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 POLR2B-213ENST00000639658 3300 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PSG1-202ENST00000312439 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
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KCNMA1Q12791 LIMA1-212ENST00000552491 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
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KCNMA1Q12791 SNORD65-201ENST00000391079 73 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNA5SP178-201ENST00000410380 128 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 RNU4-78P-201ENST00000410940 126 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 BTF3P9-201ENST00000418784 283 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
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KCNMA1Q12791 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 HIGD1AP5-201ENST00000529959 259 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC024405.2-202ENST00000532731 184 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AP001992.1-201ENST00000533875 723 ntTSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC010197.1-201ENST00000541860 578 ntTSL 4 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC010185.1-201ENST00000542489 456 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 TRAV15-201ENST00000556680 249 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC007563.2-202ENST00000607591 394 ntTSL 3 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC010378.1-201ENST00000619270 362 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 DROSHA-212ENST00000511367 5305 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 MOB1B-201ENST00000309395 6963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC100757.1-201ENST00000616872 1835 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 OR7C1-204ENST00000642000 11290 ntAPPRIS P1 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PREPL-216ENST00000541738 6049 ntTSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 PIGA-206ENST00000542278 3626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 ADAMDEC1-204ENST00000522298 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 FCRL2-203ENST00000368181 1669 ntTSL 1 (best) BASIC6.01□□□□□ -1.45
KCNMA1Q12791 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6□□□□□ -1.45
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