Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC010132.1-201ENST00000433315 561 ntTSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL139289.1-201ENST00000436713 731 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC006037.1-201ENST00000437967 287 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 CYCSP24-201ENST00000445119 316 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 OR1H1P-201ENST00000448731 937 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 snoU13.7-201ENST00000459220 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC010326.1-201ENST00000462726 602 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC016746.1-201ENST00000489557 831 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RN7SKP92-201ENST00000517266 244 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AF233439.1-201ENST00000526235 401 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 LINC01290-201ENST00000566787 502 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 MIR5699-201ENST00000578903 90 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RPL23AP92-201ENST00000603609 255 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC115621.1-201ENST00000604653 858 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL590392.1-201ENST00000604960 446 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL121932.1-201ENST00000605542 214 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 SFT2D2-201ENST00000271375 11040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 LPAR4-201ENST00000435339 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 FAM133A-201ENST00000322139 3292 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 CYP4Z1-201ENST00000334194 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 SLC26A7-201ENST00000276609 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 ZNF260-204ENST00000592282 5055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 GPHN-204ENST00000543237 2459 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 PDE4B-201ENST00000329654 3998 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 PIK3C3-217ENST00000639914 2722 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 GABRA2-202ENST00000381620 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 BBOX1-202ENST00000525090 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RYR3-209ENST00000634418 15078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC011755.1-201ENST00000623763 2049 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 FAM46D-202ENST00000538312 3106 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 SUPT3H-203ENST00000371460 2389 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 GSTA3-201ENST00000211122 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 Y_RNA.394-201ENST00000383942 103 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC078974.1-201ENST00000411597 223 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC093865.1-201ENST00000415387 433 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL139118.1-201ENST00000432707 446 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RPL35AP21-201ENST00000437667 333 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC009987.1-201ENST00000446888 806 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC114814.3-201ENST00000449362 663 ntTSL 2 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RPS5P7-201ENST00000456664 608 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 PLGLA-201ENST00000465668 449 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC007537.2-201ENST00000472093 511 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RN7SL809P-201ENST00000482040 297 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC073429.1-201ENST00000511749 503 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RNA5SP230-201ENST00000517039 122 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC009643.1-201ENST00000532030 391 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC084880.2-201ENST00000536009 501 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 NOVA1-AS1-203ENST00000552101 468 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC055876.1-202ENST00000567053 138 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC020978.4-201ENST00000569088 460 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 FAM27B-201ENST00000610601 213 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL365204.3-201ENST00000612448 685 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 C7orf77-201ENST00000616258 548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC138649.5-201ENST00000637456 137 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 LYVE1-201ENST00000256178 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 SLC9B1-202ENST00000394789 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 VWC2L-202ENST00000427124 4480 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 OR7A5-201ENST00000322301 4216 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC105074.1-201ENST00000623380 3095 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 PPIG-201ENST00000260970 6368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 FRMD7-202ENST00000370879 2864 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 KPNA2P2-201ENST00000419546 1489 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 RPL34-AS1-202ENST00000507248 3713 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 TLK1P1-201ENST00000456760 2440 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 CDON-206ENST00000531738 5803 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 TRBV21OR9-2-201ENST00000331828 367 ntAPPRIS P1 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 PRIM2-202ENST00000370687 909 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL162394.1-201ENST00000413271 419 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC104462.1-201ENST00000414565 447 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 SNRPFP1-201ENST00000414761 252 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC005062.1-207ENST00000418442 587 ntTSL 3 BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 ELOCP4-201ENST00000420090 333 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AL592293.2-201ENST00000422292 996 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC007283.2-201ENST00000424739 197 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC016691.1-201ENST00000441321 413 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 ATP6V0E1P2-201ENST00000441771 245 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 HMGB3P9-201ENST00000441799 583 ntBASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.45
PTPN12Q05209 AC121764.3-201ENST00000465946 384 ntTSL 2 BASIC5.97□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms