Protein–RNA interactions for Protein: P49454

CENPF, Centromere protein F, humanhuman

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Length 3,210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPFP49454 ATP6V1G3-203ENST00000367382 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
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CENPFP49454 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CENPFP49454 AP005059.2-201ENST00000577527 578 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CENPFP49454 AC096708.3-201ENST00000584226 559 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CENPFP49454 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CENPFP49454 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CENPFP49454 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CENPFP49454 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CENPFP49454 BAZ2B-204ENST00000392783 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 RNA5SP325-201ENST00000363756 130 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 AP000477.2-201ENST00000447405 778 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 AC128687.1-201ENST00000605304 619 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
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CENPFP49454 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 LANCL1-AS1-201ENST00000416344 714 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 RPS15AP28-201ENST00000435088 386 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 RPL23AP74-201ENST00000437246 471 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 AL451137.1-201ENST00000523363 443 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CENPFP49454 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
CENPFP49454 OR5M3-201ENST00000312240 1051 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -2
CENPFP49454 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CENPFP49454 IL20-201ENST00000367096 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
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CENPFP49454 PTP4A1P7-201ENST00000423476 514 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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CENPFP49454 PSMD5-AS1-215ENST00000640622 205 ntBASIC2.59□□□□□ -2
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CENPFP49454 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
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CENPFP49454 AC107398.1-201ENST00000486904 505 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CENPFP49454 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CENPFP49454 FER-202ENST00000438717 1531 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CENPFP49454 C1D-204ENST00000410067 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CENPFP49454 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CENPFP49454 AC004520.1-201ENST00000608362 1413 ntBASIC2.58□□□□□ -2
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CENPFP49454 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
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CENPFP49454 DST-220ENST00000518935 3547 ntTSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
CENPFP49454 YWHAZ-219ENST00000522542 1394 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
CENPFP49454 AC025125.1-201ENST00000624743 1922 ntBASIC2.57□□□□□ -2
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CENPFP49454 MTCYBP20-201ENST00000524239 1129 ntBASIC2.56□□□□□ -2
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