Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC079070.1-201ENST00000578740 555 ntTSL 2 BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL139286.1-201ENST00000604465 483 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MIR7153-201ENST00000637758 57 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL359893.1-201ENST00000447628 1580 ntBASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.61□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 OR14A16-201ENST00000357627 930 ntAPPRIS P1 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 Y_RNA.122-201ENST00000363331 96 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL355379.1-201ENST00000405542 640 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 RPL23AP14-201ENST00000468281 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 RNU4ATAC15P-201ENST00000516415 126 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 MTND5P28-201ENST00000438005 1594 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 CLECL1-201ENST00000327839 670 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 RNU1-91P-201ENST00000364746 163 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AL136322.1-201ENST00000422250 548 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 AC093422.2-201ENST00000452599 686 ntTSL 2 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 LINC02460-201ENST00000543558 536 ntTSL 4 BASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 BMS1P7-201ENST00000602440 1052 ntBASIC3.6□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 VNN1-201ENST00000367928 3106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 ASPN-201ENST00000375543 2237 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.83
PTPRMP28827 FKTN-201ENST00000223528 7364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC087565.3-202ENST00000642085 1603 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 CCDC168-201ENST00000322527 21466 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 CXorf51B-201ENST00000438525 436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC245517.2-201ENST00000442890 346 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RPL36AP51-201ENST00000487216 318 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC079160.1-201ENST00000513489 739 ntTSL 1 (best) BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AP000857.1-201ENST00000532151 543 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 LINC00640-203ENST00000556479 576 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL133371.2-201ENST00000556624 294 ntTSL 3 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC103710.2-201ENST00000609912 942 ntBASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ERBIN-203ENST00000380938 4701 ntTSL 2 BASIC3.59□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 GPR34-202ENST00000378142 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC138915.3-201ENST00000562908 1389 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RNA5SP88-201ENST00000365560 109 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 KRTAP27-1-201ENST00000382835 682 ntAPPRIS P1 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SUMO1-205ENST00000409205 534 ntTSL 2 BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRMP28827 AC011816.1-201ENST00000441346 546 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC021146.5-201ENST00000503544 545 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRMP28827 OR8L1P-201ENST00000534005 955 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 GNAI2P1-201ENST00000541815 315 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RPL23AP84-201ENST00000571193 464 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC023813.4-201ENST00000607580 580 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC074140.1-201ENST00000621617 208 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.58□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SLC39A10-202ENST00000409086 5432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.58□□□□□ -1.84
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PTPRMP28827 LRRC39-203ENST00000370138 1466 ntTSL 5 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RNU2-22P-201ENST00000411266 212 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC080125.1-201ENST00000414888 684 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 IPMKP1-201ENST00000425988 855 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MRPL50P4-201ENST00000446432 475 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MTCO1P42-201ENST00000457379 726 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC021739.4-201ENST00000561417 569 ntTSL 4 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL022099.1-201ENST00000604551 712 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL162233.1-201ENST00000620014 944 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC092628.2-201ENST00000622492 339 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MFSD8-245ENST00000641743 948 ntBASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 OR2J3-203ENST00000641960 3342 ntAPPRIS P1 BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.57□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC104090.1-201ENST00000506341 1171 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 LINC01332-201ENST00000506612 502 ntTSL 4 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC037487.4-201ENST00000577423 625 ntTSL 3 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 CEP164P1-207ENST00000608660 504 ntTSL 5 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 Z73965.1-201ENST00000623412 2297 ntBASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 ZBTB20-201ENST00000357258 27125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.56□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AC004160.1-212ENST00000421121 2078 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 KIAA1109-203ENST00000388738 15574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 DEFB4B-201ENST00000318157 332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 PTPRC-202ENST00000367364 1017 ntTSL 1 (best) BASIC3.55□□□□□ -1.84
PTPRMP28827 AL590084.1-201ENST00000407885 387 ntBASIC3.55□□□□□ -1.84
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