Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Length 708 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 OR51B6-201ENST00000380219 939 ntAPPRIS P1 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MIR621-201ENST00000384919 96 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC116036.1-201ENST00000412199 367 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 DCN-203ENST00000420120 753 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL513188.1-201ENST00000421167 614 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC079799.1-201ENST00000430696 331 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ELOCP18-201ENST00000434209 337 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC092422.1-201ENST00000455576 584 ntTSL 4 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 COX7A2P2-201ENST00000505291 250 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC112242.1-201ENST00000515805 406 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RN7SKP70-201ENST00000516655 271 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 IGHVII-44-2-201ENST00000517728 250 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 IGHV1-14-201ENST00000523391 241 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 PAFAH1B2-206ENST00000530272 850 ntTSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL359237.1-201ENST00000554305 826 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL133371.1-201ENST00000555481 764 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC007956.1-201ENST00000555623 542 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RPL38-208ENST00000584577 344 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC012368.3-201ENST00000604190 219 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TLR10-207ENST00000613579 3801 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 uc_338.29-201ENST00000615099 168 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC089999.3-201ENST00000622440 577 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SNAP23-223ENST00000627440 210 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 C2orf83-206ENST00000642055 453 ntAPPRIS P3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL137003.2-201ENST00000606924 2538 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MBNL3-206ENST00000394311 11263 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 GPR65-201ENST00000267549 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC105235.1-201ENST00000623208 1816 ntBASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SCARB2-207ENST00000638295 4507 ntTSL 5 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 LSAMP-207ENST00000539563 8821 ntTSL 3 BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CLEC9A-201ENST00000355819 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC068769.1-201ENST00000474767 2426 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 POC1B-201ENST00000313546 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CDH12-208ENST00000522262 3028 ntTSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 OR4K13-202ENST00000641664 5980 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC074141.1-201ENST00000588129 2995 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 HSP90AA5P-201ENST00000438353 2192 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ERCC6L-202ENST00000373657 4344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 KANTR-203ENST00000604062 4251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CLCC1-204ENST00000369968 4151 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TTF2-201ENST00000369466 9462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TRAT1-201ENST00000295756 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-701P-201ENST00000384059 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-658P-201ENST00000384606 106 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL359694.1-201ENST00000403247 604 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC069218.2-201ENST00000411665 344 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 RPS4XP20-201ENST00000505751 772 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 AC023442.3-203ENST00000530946 533 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC010809.1-201ENST00000560268 562 ntTSL 3 BASIC6.61□□□□□ -1.35
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RABGEF1Q9UJ41 AC010271.1-201ENST00000599050 558 ntTSL 4 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC068790.4-201ENST00000602474 263 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC008555.7-201ENST00000605008 583 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNHIT3-208ENST00000619730 926 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 IKZF3-210ENST00000377958 1837 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TMEM257-201ENST00000408967 2441 ntAPPRIS P1 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 TPH1-201ENST00000250018 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 VNN3-207ENST00000425515 1761 ntTSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF112-201ENST00000337401 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZNF329-201ENST00000358067 3290 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 NBPF19-205ENST00000612881 3715 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC6.61□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 CD53-201ENST00000271324 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 MYO3B-202ENST00000408978 5529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 SLC35F1-202ENST00000621341 4481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 PRDM2-202ENST00000311066 7437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC016705.1-201ENST00000548231 1891 ntTSL 5 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 ZPLD1-201ENST00000306176 3619 ntTSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 HMG20A-201ENST00000336216 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC005225.5-201ENST00000623547 2225 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 PTK2-201ENST00000340930 4414 ntTSL 2 BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 KIAA0586-214ENST00000619416 8233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP350-201ENST00000363298 111 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1Q9UJ41 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC6.6□□□□□ -1.35
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