Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 TRAJ31-201ENST00000390506 57 ntAPPRIS P1 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HIGD1AP4-201ENST00000430194 280 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR548XHG-203ENST00000437492 853 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO1P48-201ENST00000448024 1096 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPS11P1-201ENST00000451072 473 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTUS2-AS2-203ENST00000452602 651 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTCO3P20-201ENST00000454926 688 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPL21P8-201ENST00000465083 535 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 NDUFA6-201ENST00000470753 475 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P11-201ENST00000508668 303 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ARL2BPP6-201ENST00000512757 439 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC010342.1-201ENST00000514047 877 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 C8orf22-204ENST00000522267 739 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC078909.1-201ENST00000559509 464 ntTSL 2 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02164-201ENST00000566684 272 ntTSL 3 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC087399.1-201ENST00000579769 573 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC005899.4-201ENST00000581915 514 ntTSL 4 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC100781.1-202ENST00000597906 463 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC012669.1-201ENST00000603209 283 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC005344.1-201ENST00000613391 459 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 KLRF1-207ENST00000617793 1096 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP003171.2-202ENST00000634657 355 ntTSL 5 BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF733P-201ENST00000331425 1506 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RXFP1-205ENST00000448688 3861 ntTSL 1 (best) BASIC3.88□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 TUBD1-214ENST00000592426 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AGTR1-206ENST00000474935 1795 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 DTWD2-201ENST00000304058 4365 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CSN1S1-201ENST00000246891 985 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SPANXN3-201ENST00000370503 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN2P8-201ENST00000391458 268 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA3.3-201ENST00000408712 125 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RHEBP3-201ENST00000411920 351 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF736P2Y-201ENST00000416040 1279 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01445-201ENST00000426205 812 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC093581.1-202ENST00000430890 391 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTND4LP10-201ENST00000435146 291 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 C4orf26-202ENST00000435974 560 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL359378.1-201ENST00000439891 400 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL139383.1-203ENST00000445227 420 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC010890.1-201ENST00000454699 469 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 DNAJC19P1-201ENST00000455312 319 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC016933.1-201ENST00000504735 539 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 NAMPTP2-201ENST00000505629 1115 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC104619.4-201ENST00000510773 249 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 HMGN1P15-201ENST00000513870 295 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-27P-201ENST00000516146 107 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AP001317.1-201ENST00000531194 960 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02386-202ENST00000551287 564 ntTSL 4 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OR4T1P-201ENST00000554933 911 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC104072.1-201ENST00000568817 668 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 FAM60BP-201ENST00000578364 658 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC087499.8-201ENST00000578406 226 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4666A-201ENST00000580160 79 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02079-201ENST00000582518 294 ntTSL 2 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC022146.1-201ENST00000595307 847 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC009220.3-201ENST00000604318 586 ntBASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ZNF461-214ENST00000618437 774 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC243585.2-201ENST00000619099 508 ntTSL 3 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 OR51F1-202ENST00000624103 939 ntAPPRIS ALT1 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RBMS3-AS3-202ENST00000635847 738 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 ATL2-202ENST00000402054 1883 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LIG4-201ENST00000356922 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.87□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 KYNU-202ENST00000375773 1772 ntTSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 FAM35DP-201ENST00000323387 2712 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-468P-201ENST00000384003 109 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL133264.1-201ENST00000407157 562 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-575P-201ENST00000411326 105 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC069282.1-201ENST00000411911 526 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC02263-202ENST00000420701 597 ntTSL 5 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 MTATP6P4-201ENST00000427725 675 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 CYCSP35-201ENST00000451978 304 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPL6P9-201ENST00000466502 859 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC073359.1-201ENST00000486545 521 ntTSL 2 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01995-201ENST00000489016 621 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P24-201ENST00000493052 752 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 AC008696.2-201ENST00000503323 825 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 WBP1LP4-201ENST00000505043 344 ntBASIC3.86□□□□□ -1.79
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC3.86□□□□□ -1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.3 ms