Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 PAIP2-205ENST00000510080 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 OR5V1-216ENST00000543825 1048 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 PSMA4-204ENST00000558094 651 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 AL513314.2-206ENST00000617276 434 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 LINC01090-203ENST00000632331 466 ntTSL 5 BASIC3.41□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
ZBED9Q6R2W3 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 CRLS1-202ENST00000378868 994 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL360182.1-201ENST00000397433 468 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 EIF4EBP2P3-201ENST00000403144 334 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 LINC01614-201ENST00000415479 648 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 USP9YP20-201ENST00000419224 558 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 TH2LCRR-202ENST00000435042 472 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL121970.1-201ENST00000447557 929 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP20-201ENST00000447965 421 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC008280.2-201ENST00000455473 307 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OR6K1P-201ENST00000456766 971 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 CFHR2-203ENST00000476712 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 NRG1-IT1-203ENST00000523743 292 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RGS4-207ENST00000527809 817 ntTSL 4 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC022655.1-201ENST00000578039 288 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC023932.1-201ENST00000582726 429 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 DCAF13P3-201ENST00000561147 1334 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 FDCSP-201ENST00000317987 566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP295-201ENST00000362655 121 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL590385.1-201ENST00000419446 462 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL353680.1-201ENST00000433788 337 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 LINC01376-204ENST00000449124 626 ntTSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC021205.1-201ENST00000468797 348 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 SNORD116-30-201ENST00000516468 85 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC025881.1-201ENST00000518851 512 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC079362.1-201ENST00000546865 525 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL163153.1-201ENST00000554223 283 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC084373.1-201ENST00000603311 235 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC012213.4-201ENST00000606457 354 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 DNAH14-210ENST00000439375 13548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MDM4-202ENST00000367180 547 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC000041.1-201ENST00000439655 175 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ATP6V1G3-204ENST00000489986 449 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC093752.2-201ENST00000506942 573 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 SNORA31.21-201ENST00000517180 77 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL161757.2-201ENST00000553800 421 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC022809.1-201ENST00000579247 428 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ATP1B3P1-201ENST00000605365 821 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AP005212.4-201ENST00000614206 710 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 SMARCA2-229ENST00000634781 1106 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 SENP7-205ENST00000394091 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC138393.1-206ENST00000540997 1886 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 CUL1P1-201ENST00000509510 2425 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ZMYM2-203ENST00000382874 10139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MFF-206ENST00000392059 1710 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ZNF639-210ENST00000621687 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 NTS-201ENST00000256010 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 KCNE2-201ENST00000290310 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL672167.1-206ENST00000356293 943 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 TRGV11-201ENST00000390340 463 ntAPPRIS P1 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC240504.1-201ENST00000395709 845 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL162578.1-201ENST00000406202 378 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AL358075.1-201ENST00000450004 649 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC027673.1-201ENST00000456245 405 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 ARPC3P2-201ENST00000457786 533 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC004053.1-201ENST00000515127 575 ntTSL 5 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AP003102.1-201ENST00000525638 661 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 AC112211.1-201ENST00000607832 305 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 EFTUD1P2-201ENST00000514817 1603 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RGS21-201ENST00000417209 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.37□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RNU6-7-201ENST00000364784 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 RNU6-8-201ENST00000365467 107 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 EIF5P1-201ENST00000400019 1231 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
ZBED9Q6R2W3 BTBD10P2-201ENST00000404779 676 ntBASIC3.36□□□□□ -1.87
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