Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 OR5T2-201ENST00000313264 1248 ntAPPRIS P2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RPL7P26-201ENST00000333817 754 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RNU6-115P-201ENST00000364310 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL139098.1-201ENST00000407291 389 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC013286.1-201ENST00000412137 381 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 TAF13P2-201ENST00000416876 286 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 OR1AA1P-201ENST00000419597 916 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 LINC01794-201ENST00000420187 549 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC010745.2-201ENST00000420404 839 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL159987.2-201ENST00000432754 307 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 HMGN2P20-201ENST00000437531 273 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL050341.1-201ENST00000447743 313 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 NEGR1-IT1-201ENST00000453121 534 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RPL32P14-201ENST00000463196 378 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 TIPARP-AS1-201ENST00000463449 735 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC008379.1-201ENST00000463655 464 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC010301.1-201ENST00000473936 355 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AP000563.1-201ENST00000490865 758 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 SAR1B-204ENST00000502539 708 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC008629.1-202ENST00000504820 525 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 ERAP2-205ENST00000510309 1275 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 IGKV2-26-201ENST00000518305 343 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC009623.2-201ENST00000522524 465 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AP002833.1-201ENST00000530572 566 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AP006295.1-201ENST00000532605 585 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC126177.3-201ENST00000551839 688 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 CYP2C60P-201ENST00000566088 139 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 MTCO3P24-201ENST00000572729 782 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC092474.3-201ENST00000603022 568 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 ELOCP35-201ENST00000604289 336 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 ACTR3BP1-201ENST00000605584 1247 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL355365.1-201ENST00000616480 294 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 LINC00560-201ENST00000564593 1599 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 MTCO1P4-201ENST00000520516 1409 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 ARHGAP12-201ENST00000311380 4625 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 MCF2-210ENST00000536274 3461 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 SLAIN1-203ENST00000351546 2394 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL513302.2-201ENST00000562313 1842 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 OFD1P5Y-201ENST00000447585 2590 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 OR2M2-201ENST00000359682 1044 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RNU6-353P-201ENST00000364266 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RNU6-609P-201ENST00000365459 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 OR6K3-202ENST00000368146 996 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 TMEM225-201ENST00000375026 1107 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RNU6-712P-201ENST00000410558 100 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 Z99755.1-201ENST00000414048 380 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 DPPA2P1-201ENST00000428060 556 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL158071.1-201ENST00000430315 461 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC068533.3-201ENST00000435524 404 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 TRIM60P18-201ENST00000441518 828 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RPL23AP16-201ENST00000441715 421 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL357552.1-201ENST00000445254 415 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 SAMSN1-AS1-201ENST00000449214 840 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC007557.1-201ENST00000451711 541 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC006539.3-201ENST00000454258 129 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC012081.1-201ENST00000462382 477 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 HMGB1P25-201ENST00000468402 607 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RPL7P5-201ENST00000471472 736 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 VPS26AP1-201ENST00000483197 979 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 FCF1P3-201ENST00000496394 590 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 SETP14-201ENST00000497538 873 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC090833.1-202ENST00000511073 781 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 EGFLAM-AS2-201ENST00000512603 466 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 EGFLAM-AS2-202ENST00000514377 539 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 ZNF705CP-201ENST00000530515 889 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC011773.2-201ENST00000551479 285 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC023824.4-201ENST00000562572 476 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 GAS5-AS1-201ENST00000602767 694 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 SRGNP1-201ENST00000603392 451 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC002487.1-201ENST00000604565 994 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL021368.1-201ENST00000607490 540 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL451074.6-201ENST00000608512 729 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
C9orf135Q5VTT2 AC009318.4-201ENST00000620496 486 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
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