Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 CT45A8-201ENST00000611438 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CT45A6-201ENST00000612878 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CT45A7-202ENST00000620885 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CEP120-203ENST00000328236 4710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 KIAA1456-203ENST00000524591 9587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CEP57L1-203ENST00000368970 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 TLR3-201ENST00000296795 6015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 FAM135A-210ENST00000505868 5173 ntTSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ZBBX-202ENST00000392764 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC092447.5-201ENST00000429367 2741 ntTSL 1 (best) BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 OBSCN-210ENST00000570156 26925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.95□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ARHGAP42P3-201ENST00000443989 2508 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 FBXL13-207ENST00000455112 2274 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AMY2B-201ENST00000361355 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 TEX11-201ENST00000344304 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 SLC9C1-201ENST00000305815 4172 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CCT4P2-201ENST00000233836 1548 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 EYA1-205ENST00000388742 3907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 FANCD2-202ENST00000383807 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 C1orf100-201ENST00000308105 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AL161781.1-201ENST00000354277 403 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 C9orf92-201ENST00000380683 359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 SPA17P1-201ENST00000416656 452 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RPL30P3-201ENST00000424262 333 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 LINC01492-202ENST00000425157 659 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC016912.1-201ENST00000432241 545 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AL356276.2-201ENST00000435919 558 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RABEPKP1-201ENST00000440529 1026 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 PGBD4P3-201ENST00000440731 581 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MTND6P13-201ENST00000443510 523 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 LINC00302-201ENST00000444515 302 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MYCBP2-AS1-202ENST00000448470 333 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 UTAT33-202ENST00000449177 565 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC073486.1-201ENST00000453278 531 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 HMGB1P15-201ENST00000453854 435 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 UMAD1-204ENST00000482067 569 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RPL35P6-201ENST00000490024 372 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RPL9P6-201ENST00000492764 598 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC097478.1-202ENST00000508021 567 ntTSL 4 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC008958.1-201ENST00000511047 682 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC108467.1-201ENST00000515623 672 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RNU6-314P-201ENST00000516574 104 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 SMIM18-201ENST00000517349 905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AP003467.2-201ENST00000520175 319 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC022790.1-201ENST00000522872 204 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AKAP7-208ENST00000537868 1006 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 LINC02311-202ENST00000556819 477 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AL133241.1-201ENST00000556832 487 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC005304.3-201ENST00000581533 511 ntTSL 3 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ZNF573-209ENST00000585724 453 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 VN1R79P-201ENST00000593540 513 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ZNF28-207ENST00000594602 684 ntTSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AL161729.4-201ENST00000604650 476 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC034229.5-201ENST00000624258 185 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC008785.1-201ENST00000624475 456 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC110994.2-201ENST00000635481 492 ntBASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 GABRA2-211ENST00000514090 3401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 FNBP1L-206ENST00000604705 1830 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ATF7IP-209ENST00000536444 8774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 DGKH-206ENST00000536612 3957 ntTSL 1 (best) BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MYBPC1-204ENST00000452455 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.94□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 GHR-202ENST00000357703 4316 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 GHR-213ENST00000622294 4312 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 TPTE2-205ENST00000400230 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 EYA1-203ENST00000388740 3788 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 ARHGAP21-218ENST00000636789 4210 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CARF-208ENST00000428585 2513 ntTSL 2 BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 SLCO1A2-201ENST00000307378 7682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RN7SKP224-201ENST00000364140 325 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 FCF1P10-201ENST00000407590 479 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 RNU6-628P-201ENST00000410675 107 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 EIF4A1P3-201ENST00000411521 244 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AC098484.2-201ENST00000414339 601 ntTSL 1 (best) BASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC4.93□□□□□ -1.62
FSCN1Q16658 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.93□□□□□ -1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.7 ms