Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC234775.1-201ENST00000454247 670 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL133162.1-201ENST00000463228 453 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC121764.1-201ENST00000472238 563 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC02000-201ENST00000483245 640 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC010468.2-201ENST00000511981 438 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC090833.1-201ENST00000513853 806 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC010255.3-204ENST00000514637 454 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LSM6P2-201ENST00000552208 177 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC00519-201ENST00000557518 682 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC023908.1-201ENST00000559899 567 ntTSL 4 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC106785.1-201ENST00000565935 262 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 VN1R88P-201ENST00000596787 292 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ZNF836-203ENST00000597065 808 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 U73023.1-201ENST00000603134 700 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL138880.2-201ENST00000616214 239 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ABCG2-204ENST00000515655 4276 ntTSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 VPS13C-203ENST00000395896 14579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC130650.2-201ENST00000618736 2403 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ZNF682-207ENST00000595736 1710 ntTSL 2 BASIC2.79□□□□□ -1.96
USF2Q15853 C18orf54-202ENST00000382911 4056 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TAS2R19-201ENST00000390673 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPL32P23-201ENST00000397237 405 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RN7SKP202-201ENST00000410439 330 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RN7SKP27-201ENST00000410684 333 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC007899.1-201ENST00000412776 775 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPS15AP38-201ENST00000413110 372 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL158839.1-201ENST00000413943 575 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL138826.1-202ENST00000415106 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CBLL1-202ENST00000415884 804 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC104777.1-203ENST00000423428 554 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPS6P14-201ENST00000425165 719 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL590623.1-201ENST00000427864 105 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC012497.1-201ENST00000429392 575 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ETF1P3-201ENST00000430422 1160 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC092598.1-201ENST00000431708 797 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC01757-201ENST00000435552 480 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL590762.3-201ENST00000436372 640 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 RPS29P7-201ENST00000439662 171 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AL359073.1-201ENST00000448036 403 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC084357.1-201ENST00000473404 255 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC108078.3-201ENST00000502633 489 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC008572.1-201ENST00000507269 442 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 LINC02112-202ENST00000512976 464 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TATDN1-206ENST00000519548 889 ntTSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP000926.4-201ENST00000527351 454 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AP002370.2-203ENST00000533101 576 ntTSL 4 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 TIMM9-209ENST00000556367 572 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC006077.1-201ENST00000604746 343 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 BNIP3P4-201ENST00000604946 565 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC004696.1-201ENST00000614345 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC099506.2-201ENST00000623074 221 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 AC084035.1-201ENST00000634543 607 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 FIGNL1-212ENST00000613602 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 CPXCR1-202ENST00000373111 1577 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
USF2Q15853 ZNF626-204ENST00000612591 4404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 POMP-202ENST00000460403 1428 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SLC38A9-203ENST00000416547 2236 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 GPR183-201ENST00000376414 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CYCSP45-201ENST00000402289 315 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RN7SKP156-201ENST00000410308 342 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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USF2Q15853 SDCBPP2-201ENST00000424643 885 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC018643.1-201ENST00000445459 414 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 OR6K5P-201ENST00000447050 945 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 CABYRP1-201ENST00000465493 1045 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC091959.2-201ENST00000477363 321 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC092059.1-201ENST00000485347 429 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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USF2Q15853 AC008957.1-201ENST00000510740 478 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC008780.1-201ENST00000513392 409 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 RNU6-579P-201ENST00000516879 102 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC104233.2-201ENST00000518922 414 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
USF2Q15853 AC109466.1-214ENST00000522762 583 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
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