Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 U3.29-201ENST00000391296 212 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MEPE-202ENST00000395102 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC096921.1-201ENST00000411661 375 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC118345.1-201ENST00000411785 366 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 C6orf52-203ENST00000426700 493 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LINC01037-201ENST00000427337 424 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP000770.1-201ENST00000444123 583 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 BX546450.1-201ENST00000454307 482 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC233279.1-201ENST00000455300 423 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC083829.1-201ENST00000503756 657 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC117522.3-201ENST00000507974 584 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RN7SKP122-201ENST00000515923 296 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RN7SKP260-201ENST00000516907 149 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC100782.1-201ENST00000520778 590 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NACA-211ENST00000548563 827 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 BNIP3P6-201ENST00000549284 499 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC009117.3-202ENST00000563825 557 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC119868.1-202ENST00000584741 347 ntTSL 2 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 DAB1-AS1-208ENST00000586465 748 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC002115.1-201ENST00000589603 568 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TTN-AS1-243ENST00000591867 748 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ZNF649-AS1-201ENST00000600329 579 ntTSL 4 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL627230.1-201ENST00000613077 211 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL591926.8-201ENST00000616876 211 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC244100.1-202ENST00000621554 382 ntBASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 GPR87-201ENST00000260843 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LCLAT1-203ENST00000379509 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 FAM35A-202ENST00000298786 3614 ntTSL 5 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LINC01197-202ENST00000555332 3568 ntTSL 3 BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ADAMDEC1-201ENST00000256412 2348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 EIF3E-201ENST00000220849 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SAMSN1-203ENST00000400566 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CCR2-202ENST00000400888 2232 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LINC01844-201ENST00000432677 2237 ntTSL 1 (best) BASIC5.58□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC099329.2-203ENST00000471537 3605 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CDC42BPA-204ENST00000366767 9320 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTRR-202ENST00000440940 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 PLD1-203ENST00000356327 5855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 KBTBD3-201ENST00000526793 3751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 EDA2R-202ENST00000374719 3418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ADAM7-202ENST00000380789 3358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 CFL2-201ENST00000298159 6747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
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CCDC85BQ15834 OR5L2-201ENST00000378397 936 ntAPPRIS P1 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RN7SKP17-201ENST00000411242 351 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 HMGN1P24-201ENST00000412282 298 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL078645.1-201ENST00000414377 423 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC092651.1-201ENST00000426110 312 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RPL34P6-201ENST00000432390 345 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 IFNA20P-201ENST00000436840 528 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MTND6P18-201ENST00000439477 513 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC092754.1-201ENST00000472975 479 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RN7SL244P-201ENST00000493405 297 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 COX6B1P5-201ENST00000509843 249 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP001207.3-201ENST00000520268 491 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 LINCR-0001-203ENST00000524047 545 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC006518.2-202ENST00000544947 297 ntTSL 2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL132780.1-201ENST00000548819 556 ntTSL 4 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AP001029.3-201ENST00000588063 596 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC113194.1-201ENST00000606037 500 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC004908.2-201ENST00000609090 574 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AL356130.2-201ENST00000612554 404 ntTSL 3 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC002550.2-201ENST00000621246 394 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC079684.1-201ENST00000621405 437 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 AC000095.2-202ENST00000637415 154 ntBASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 SPAM1-205ENST00000439500 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 FILIP1-202ENST00000370020 4051 ntTSL 1 (best) BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 MAPK10-297ENST00000641287 3725 ntAPPRIS P2 BASIC5.57□□□□□ -1.52
CCDC85BQ15834 IKZF2-207ENST00000434687 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.57□□□□□ -1.52
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