Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 GAPDHP27-201ENST00000447427 1020 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC018742.1-202ENST00000457901 504 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 C1orf105-204ENST00000460397 462 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC020651.1-201ENST00000490324 360 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC017091.1-202ENST00000510941 504 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC106800.3-201ENST00000511389 308 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC02117-201ENST00000513673 540 ntTSL 4 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC00861-202ENST00000517869 606 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 OR52B2-201ENST00000530810 1079 ntAPPRIS P1 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC092490.1-202ENST00000540299 809 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC128707.1-201ENST00000552230 494 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ADAMTS7P4-205ENST00000560651 453 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC113418.1-201ENST00000569928 517 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC144836.1-201ENST00000575911 340 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CDC37L1-AS1-202ENST00000609131 235 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL445647.2-201ENST00000615170 130 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL118522.2-201ENST00000616045 615 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MIR6130-201ENST00000619419 109 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC243312.2-201ENST00000623340 601 ntBASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 SCYL3-201ENST00000367770 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 OSBPL9-205ENST00000447887 2940 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZNF283-203ENST00000588797 2428 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ESRRG-203ENST00000361395 5216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ESRRG-209ENST00000408911 5216 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CNTN5-204ENST00000524871 6258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NCOA7-201ENST00000229634 2998 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZNF484-202ENST00000375495 2867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 FKBP5-202ENST00000536438 3940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 VEPH1-205ENST00000468233 1401 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MIR3681HG-201ENST00000412294 2183 ntTSL 2 BASIC6.5□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NUP153-201ENST00000262077 5487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ESRRG-206ENST00000366938 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 PCGF5-204ENST00000543648 7144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 TTN-AS1-203ENST00000419746 4592 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNA5SP46-201ENST00000362370 120 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL451142.1-201ENST00000375867 775 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU1-46P-201ENST00000384425 164 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL139039.1-201ENST00000401900 692 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MIR1286-201ENST00000408112 78 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AF015720.1-201ENST00000412240 349 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL137014.1-201ENST00000420490 1226 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC093151.1-201ENST00000427711 313 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC137630.2-202ENST00000429681 555 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL451136.1-201ENST00000435399 325 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RPL12P46-201ENST00000436610 195 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NEFMP1-201ENST00000443423 1006 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MRPL48P1-201ENST00000445390 636 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 IGHV5-78-201ENST00000450948 295 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC01206-203ENST00000476815 482 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC01340-201ENST00000504012 724 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 IL7R-208ENST00000511982 612 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-635P-201ENST00000516651 102 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 SNORD116.3-201ENST00000517176 78 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC104763.2-201ENST00000604179 382 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 IGHV3-29-201ENST00000604817 344 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC245041.2-202ENST00000613389 493 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LAMTOR5-AS1-244ENST00000629484 780 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC245187.2-201ENST00000631520 475 ntTSL 3 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 NR5A2-203ENST00000367362 5086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 DCC-215ENST00000581580 3517 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 FAM208A-210ENST00000614531 3441 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MROH2B-201ENST00000399564 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 TTI1-203ENST00000449821 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 OLMALINC-203ENST00000641087 3779 ntBASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZNF271P-205ENST00000639248 4573 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNMT-206ENST00000589866 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 MRE11-204ENST00000407439 2684 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZNF480-205ENST00000595962 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 SOX5-205ENST00000451604 4261 ntTSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 ZNF337-AS1-201ENST00000414393 4666 ntTSL 2 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 CBLL1-201ENST00000222597 2003 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AL158064.2-203ENST00000639897 2003 ntTSL 5 BASIC6.49□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 KIAA1109-201ENST00000264501 15896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC00284-201ENST00000423211 3208 ntTSL 2 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 SPHKAP-201ENST00000344657 6804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 APOL6-201ENST00000409652 10121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LMO3-202ENST00000320122 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-190P-201ENST00000384154 102 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC013442.1-201ENST00000397347 228 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 AC112721.2-201ENST00000409910 541 ntTSL 4 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 LINC00310-202ENST00000419881 910 ntTSL 5 BASIC6.48□□□□□ -1.37
SKIV2LQ15477 RPS27AP12-201ENST00000429552 465 ntBASIC6.48□□□□□ -1.37
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