Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 AC097468.3-201ENST00000607956 456 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AL353600.1-201ENST00000608148 251 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC040168.1-201ENST00000623594 991 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 CRYM-AS1-204ENST00000637983 556 ntBASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 LYST-201ENST00000389793 13480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 CCDC102B-201ENST00000360242 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RPS6KA6-204ENST00000620340 8169 ntTSL 5 BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.04□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 LRRC63-203ENST00000595396 2327 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 DCAF13P1-201ENST00000495256 1330 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 CFTR-201ENST00000003084 6132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 OR52E6-201ENST00000329322 970 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 FAM26F-203ENST00000368606 546 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 TRAV9-2-201ENST00000390441 394 ntAPPRIS P1 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RNA5SP317-201ENST00000410176 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RNA5SP311-201ENST00000411290 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 MTCO1P17-201ENST00000411522 491 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AL133343.3-201ENST00000413983 469 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AP000432.1-201ENST00000416641 516 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC023590.1-205ENST00000430457 676 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AL365184.2-201ENST00000431139 435 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 EZH2P1-201ENST00000431167 291 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AL121957.1-201ENST00000441532 338 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 LINC00529-201ENST00000443854 241 ntTSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 BMI1P1-201ENST00000445879 941 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RPL36AP13-201ENST00000457490 317 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RPS4XP10-201ENST00000465034 731 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AP001025.2-201ENST00000490908 477 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC023424.2-201ENST00000493479 777 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC006390.1-201ENST00000508068 283 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 MTND5P13-201ENST00000513046 1079 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC034159.1-201ENST00000513885 583 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RNA5SP315-201ENST00000516340 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 RNA5SP312-201ENST00000517068 116 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC090796.1-201ENST00000520370 567 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC013828.2-201ENST00000532487 235 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC027018.1-201ENST00000533978 396 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 PRB1-204ENST00000546254 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AL160191.1-202ENST00000554008 576 ntTSL 4 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC135507.1-201ENST00000607214 561 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC021755.1-201ENST00000559747 1447 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 DEPDC1-202ENST00000456315 5331 ntTSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 SLC44A5-202ENST00000370859 3896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 AC116667.1-201ENST00000604855 2072 ntBASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 MPDZ-211ENST00000536827 6176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.03□□□□□ -1.6
TTF1Q15361 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 EIF2A-201ENST00000273435 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 RNU6-989P-201ENST00000362756 107 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 LINC01423-201ENST00000414189 608 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 LINC01884-201ENST00000433429 440 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AL139275.2-201ENST00000444731 539 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC073387.1-201ENST00000453261 709 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 RPL38P1-201ENST00000460914 211 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 RPS26P28-201ENST00000470806 348 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 PLSCR5-AS1-201ENST00000473817 450 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 ST13P14-201ENST00000474095 734 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AL024509.2-201ENST00000493462 493 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC034222.1-201ENST00000494052 532 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 ARNTL2-AS1-201ENST00000500498 804 ntTSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 LINC02173-201ENST00000504132 521 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 STMN1P2-201ENST00000508435 439 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC093677.1-201ENST00000514414 678 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 RN7SKP21-201ENST00000516503 220 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 OR4P1P-201ENST00000530808 1136 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 FOPNL-204ENST00000573396 735 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC024267.4-202ENST00000582631 436 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 PDZPH1P-202ENST00000602846 722 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 PRELID3BP8-201ENST00000604148 295 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 RNU4-89P-201ENST00000607443 133 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC103710.4-201ENST00000609301 899 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AL354821.1-201ENST00000617598 809 ntTSL 3 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AP005264.7-201ENST00000625003 745 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC091925.2-201ENST00000625059 256 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC092447.10-201ENST00000620607 1652 ntBASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.02□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 C4orf17-204ENST00000514652 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 CRISP1-202ENST00000335847 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 ZC3H7A-202ENST00000396516 3845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 MTX3-203ENST00000512560 4799 ntTSL 2 BASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 OR11H4-201ENST00000315409 1082 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 RNU6-263P-201ENST00000363811 107 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC109780.2-201ENST00000413467 845 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 MRPS18BP2-201ENST00000434310 759 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
TTF1Q15361 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC5.01□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 130.3 ms