Protein–RNA interactions for Protein: Q15042

RAB3GAP1, Rab3 GTPase-activating protein catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3GAP1Q15042 ELOCP19-201ENST00000411919 318 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC091705.1-201ENST00000412197 209 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL589642.2-201ENST00000413291 839 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL136133.1-201ENST00000413694 376 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL732292.1-201ENST00000426692 226 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 LINC00382-201ENST00000427918 890 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC007003.1-202ENST00000439318 349 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 LINC01768-201ENST00000453347 476 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 RAD23BP3-201ENST00000454157 1152 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 FTH1P2-201ENST00000466086 412 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 MME-AS1-201ENST00000484721 828 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 RPL36AP41-201ENST00000493820 306 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 SLIT2-IT1-201ENST00000515882 601 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC004801.3-201ENST00000547602 962 ntTSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL162311.1-201ENST00000553046 601 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 SLC12A1-210ENST00000561031 735 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC135012.2-201ENST00000600234 479 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL356218.2-201ENST00000605264 187 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC090525.3-201ENST00000605601 189 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 LINC01358-205ENST00000625548 874 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 U3.53-201ENST00000628922 216 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 ATE1-AS1-202ENST00000636460 506 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 CENPE-208ENST00000611174 8260 ntTSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC108467.2-201ENST00000617640 1597 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 OR51H2P-202ENST00000641424 3046 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 DDHD2-202ENST00000517385 4113 ntTSL 2 BASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC5.5□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 TMEM255A-202ENST00000371352 2879 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 C17orf78-204ENST00000615133 1862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 TPRG1-201ENST00000345063 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 ZNF207-203ENST00000394670 13781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 BX664718.1-201ENST00000439824 3224 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 OR5I1-201ENST00000301532 945 ntAPPRIS P1 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 VNN2-201ENST00000326499 2118 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 SNORA62.2-201ENST00000364672 152 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 FAM107B-204ENST00000378465 1052 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL354726.1-201ENST00000411981 402 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 GSTM3P2-201ENST00000412746 530 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC004690.1-201ENST00000418216 328 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 ZNF90P2-204ENST00000419323 1075 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC083875.1-201ENST00000419509 405 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL158166.2-201ENST00000420845 748 ntTSL 2 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 CHIAP3-201ENST00000423668 1133 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC013402.2-201ENST00000424257 437 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 USP9YP36-201ENST00000424581 829 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL158073.1-201ENST00000426848 1104 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL139824.1-201ENST00000431983 453 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 SDCBPP1-201ENST00000440192 890 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC015724.1-201ENST00000478577 156 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 CSN1S1-202ENST00000505782 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 CSN1S1-204ENST00000507772 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 RNU6-583P-201ENST00000516012 92 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AP001992.1-204ENST00000525104 687 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC007368.1-201ENST00000536422 974 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC091231.1-201ENST00000558443 391 ntTSL 5 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC084783.1-201ENST00000565846 910 ntBASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC007952.9-201ENST00000584365 191 ntTSL 3 BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC011912.1-201ENST00000623483 5819 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 FCHSD2-205ENST00000409853 1867 ntTSL 1 (best) BASIC5.49□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 MLH3-212ENST00000556740 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 CARF-203ENST00000414439 2099 ntTSL 2 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 DBF4P1-201ENST00000412976 1892 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 API5-210ENST00000534600 1760 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 CTSS-201ENST00000368985 4107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 FRG1BP-201ENST00000278882 761 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 FRG1CP-201ENST00000358464 769 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 RNU6-1122P-201ENST00000384449 107 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 Y_RNA.548-201ENST00000384656 105 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 MIR1302-11-201ENST00000408051 138 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 MIR1302-9-201ENST00000408365 138 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 MIR1302-10-201ENST00000408734 138 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AL160275.2-201ENST00000412010 394 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 JKAMPP1-201ENST00000413804 919 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 AC092634.6-201ENST00000418558 192 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
RAB3GAP1Q15042 BTF3L4P3-201ENST00000418879 476 ntBASIC5.48□□□□□ -1.53
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